More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0012 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
129 aa  250  5.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  66.13 
 
 
127 aa  168  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  64.52 
 
 
129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  65 
 
 
130 aa  155  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  58.4 
 
 
129 aa  152  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  59.2 
 
 
128 aa  127  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0191  camphor resistance protein CrcB  59.2 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  48.7 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  47.32 
 
 
124 aa  89.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  40.54 
 
 
134 aa  89.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  41.67 
 
 
131 aa  89  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  44.17 
 
 
123 aa  87.8  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  42.62 
 
 
128 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  44.63 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  44.63 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  43.8 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 
122 aa  84  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  36.29 
 
 
143 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 
122 aa  82  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  37.61 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  43.7 
 
 
122 aa  82  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  35.48 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  41.6 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  40.37 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  45.52 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  38.84 
 
 
118 aa  79.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  40.34 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  42.86 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  38.94 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  39.84 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  34.96 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  41.75 
 
 
124 aa  77  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  40.52 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  42.98 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  40.19 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  42.4 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  41.6 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  36.89 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  43 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  40.19 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  40.19 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  43.55 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  38.66 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  42.11 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  37.61 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  40.5 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  42.48 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  40.74 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  45.26 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  36.72 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  39.25 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  40.74 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  41.35 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  40.98 
 
 
117 aa  73.6  0.0000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  38.39 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  35.2 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  37.93 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  40.62 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  35.77 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  39.39 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  40.87 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  40.87 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  40.87 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  38.05 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  35.2 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  39.2 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1562  crcB protein  34.58 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  40.87 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  37.38 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  38.89 
 
 
154 aa  70.1  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  35.65 
 
 
122 aa  70.1  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  33.33 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  40.87 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  37.82 
 
 
122 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  40.87 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  37.7 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>