29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_9033 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_9033  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  200  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0400  hypothetical protein  79.38 
 
 
97 aa  160  6e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.291534  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4929  hypothetical protein  75.51 
 
 
99 aa  158  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0534  hypothetical protein  75.26 
 
 
98 aa  154  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.517904  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0235  hypothetical protein  77.32 
 
 
101 aa  153  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0300  hypothetical protein  76.29 
 
 
98 aa  152  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.572667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9318  hypothetical protein  72.92 
 
 
100 aa  148  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04640  hypothetical protein  73.47 
 
 
98 aa  148  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.866148  normal  0.749762 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3148  hypothetical protein  74.23 
 
 
98 aa  147  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.425898  hitchhiker  0.00395835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1570  hypothetical protein  68.37 
 
 
121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146653  normal  0.0127829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2700  hypothetical protein  69.39 
 
 
104 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0357766  normal  0.762347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1020  hypothetical protein  68.75 
 
 
120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.452901  hitchhiker  0.000337165 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0467  hypothetical protein  72.16 
 
 
99 aa  144  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35047  normal  0.201608 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3838  hypothetical protein  69.07 
 
 
104 aa  143  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1642  hypothetical protein  67.35 
 
 
135 aa  143  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0065  hypothetical protein  68.37 
 
 
124 aa  143  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0428  hypothetical protein  69.15 
 
 
101 aa  143  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.621933  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12400  hypothetical protein  66.33 
 
 
105 aa  142  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0516  hypothetical protein  69.15 
 
 
111 aa  142  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.307623  decreased coverage  0.000464389 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0701  hypothetical protein  67.68 
 
 
100 aa  142  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0030  hypothetical protein  67.37 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3472  hypothetical protein  63.92 
 
 
104 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0110001 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3524  hypothetical protein  63.92 
 
 
104 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193303  normal  0.514462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3461  hypothetical protein  63.92 
 
 
104 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.886335  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3164  hypothetical protein  67.01 
 
 
170 aa  137  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0564  hypothetical protein  69.15 
 
 
94 aa  137  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7249  hypothetical protein  72.73 
 
 
104 aa  134  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121942  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0155  hypothetical protein  71.13 
 
 
127 aa  130  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0157279  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2767  Transcription regulator of the Arc/MetJ class- like protein  63.44 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.07573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>