102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_9018 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 		 119 aa  236  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2556  transcriptional repressor, CopY family  47.52 
 
 		 109 aa  87.8  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000130945  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1663  transcriptional repressor, CopY family  44.64 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000951511  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2233  CopY family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7010  CopY family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4290  transcriptional repressor, CopY family  42.74 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  42.2 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5280  CopY family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219064  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  45.1 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  41.07 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0967  transcriptional repressor, CopY family  43.75 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.624579  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  37.84 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  41.59 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1615  transcriptional repressor, CopY family  36.07 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000186217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  39.47 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  37.5 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  39.47 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  34.86 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1621  CopY family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00707917  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  37.5 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  33.62 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  33.62 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  37.04 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  36.94 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  36.04 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  40.59 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  38.38 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  38.79 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3609  transcriptional repressor, CopY family  37.96 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0225174  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  32.14 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  32.14 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  34.86 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  38.82 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  36 
 
 		 138 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  32.43 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  29.82 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  30.36 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  30.43 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  36.28 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  34.55 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6581  CopY family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  31.58 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1873  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171303  hitchhiker  0.00000000171103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  35.24 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  35.53 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  32.35 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  32.35 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  32.63 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  36.49 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  33.04 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  35.94 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  35.05 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  26.79 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0560  transcriptional repressor, CopY family  31.58 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  29.63 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3586  putative penicillinase repressor, transcriptional regulatory protein  37.29 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  23.68 
 
 		 123 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 123 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  23.68 
 
 		 123 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 122 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  32.11 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  24.07 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  26 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2840  CopY family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.941683  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>