111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_9016 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_9016  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  100 
 
 
259 aa  512  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  0.212694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2782  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  58.4 
 
 
256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.674441  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0065  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  55.95 
 
 
264 aa  263  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0743  hypothetical protein  42.25 
 
 
257 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848227  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1532  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  45.85 
 
 
254 aa  180  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2447  hypothetical protein  41.38 
 
 
261 aa  179  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0935429  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2243  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  46.72 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241494  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3659  hypothetical protein  43.6 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1704  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  46.33 
 
 
262 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.332773  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1256  hypothetical protein  38.91 
 
 
258 aa  169  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1631  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  47.01 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.995531  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0910  hypothetical protein  40.47 
 
 
261 aa  158  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4668  hypothetical protein  39.37 
 
 
266 aa  155  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5751  hypothetical protein  34.77 
 
 
258 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4707  hypothetical protein  28.41 
 
 
282 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161538  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3111  hypothetical protein  28.31 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5715  hypothetical protein  25.99 
 
 
307 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3083  hypothetical protein  29 
 
 
266 aa  92.4  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00986459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2585  protein Pfam: Lactamase_B  26.32 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0098  hypothetical protein  26.05 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.080433  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0725  beta-lactamase domain-containing protein  23.55 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.340687  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4915  putative Zn-dependent hydrolase of beta- lactamase fold family  28.24 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03523  conserved hypothetical protein  25 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.077158  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1482  hypothetical protein  27.72 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  25.1 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10421  conserved hypothetical protein  23.71 
 
 
338 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.876476 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2498  beta-lactamase domain-containing protein  23.31 
 
 
255 aa  62  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0684369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2548  beta-lactamase domain-containing protein  23.31 
 
 
255 aa  62  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2954  Beta-lactamase-like  22.01 
 
 
255 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938277  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  27.9 
 
 
332 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03400  hypothetical protein  23.78 
 
 
366 aa  60.8  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3185  hypothetical protein  23.01 
 
 
258 aa  58.9  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1261  beta-lactamase-like protein  29.12 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  25.97 
 
 
361 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  25.67 
 
 
308 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1858  hypothetical protein  22.3 
 
 
293 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00276087  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1365  putative secreted protein  22.1 
 
 
299 aa  55.8  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0171  beta-lactamase domain protein  26.4 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.389307  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1544  hypothetical protein  30.36 
 
 
266 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.133061 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2279  beta-lactamase domain protein  27.65 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1196  beta-lactamase domain protein  28.97 
 
 
274 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4971  beta-lactamase domain-containing protein  26.56 
 
 
255 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0151  metallo-beta-lactamase family protein  26.58 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1068  Beta-lactamase-like  28.28 
 
 
274 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0081  beta-lactamase domain-containing protein  27.12 
 
 
239 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.316272  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  23.46 
 
 
324 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  25.53 
 
 
377 aa  53.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.81 
 
 
590 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  25.56 
 
 
336 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1127  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 
274 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.852965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  23.46 
 
 
324 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  23.46 
 
 
324 aa  52.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  23.46 
 
 
324 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  27.83 
 
 
233 aa  52.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2243  hypothetical protein  31.33 
 
 
257 aa  52  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal  0.828679 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  29.74 
 
 
409 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  25.51 
 
 
296 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  22.65 
 
 
380 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3459  hypothetical protein  23.26 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0233834 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  22.9 
 
 
324 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  23.22 
 
 
324 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  28.68 
 
 
344 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2326  hypothetical protein  21.61 
 
 
309 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0500468 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1421  beta-lactamase domain-containing protein  34.01 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.831543  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  22.75 
 
 
367 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 
363 aa  49.7  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  24.89 
 
 
377 aa  49.7  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2127  metallo-beta-lactamase family protein  23.67 
 
 
246 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2793  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.15 
 
 
378 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  22.88 
 
 
364 aa  48.9  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5227  beta-lactamase domain protein  29.57 
 
 
224 aa  48.9  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  23.68 
 
 
423 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1493  metal-dependent hydrolase  26.09 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.264611  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25 
 
 
419 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  22.99 
 
 
324 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  22.61 
 
 
324 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  26.2 
 
 
376 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  21.43 
 
 
333 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0760  beta-lactamase domain protein  25.29 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  25.7 
 
 
225 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.91 
 
 
385 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  25.48 
 
 
335 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0514  outer membrane protein  28.16 
 
 
398 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  21.3 
 
 
320 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1774  beta-lactamase domain protein  26.99 
 
 
239 aa  46.6  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613108  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  24.81 
 
 
227 aa  46.2  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  27.2 
 
 
335 aa  45.8  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  23.89 
 
 
367 aa  45.8  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  25.52 
 
 
361 aa  45.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1801  beta-lactamase  27.47 
 
 
244 aa  45.4  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.204896  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2786  hypothetical protein  23.33 
 
 
392 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0783  hypothetical protein  26.07 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  23.32 
 
 
351 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  25.09 
 
 
360 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  24.4 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  24.5 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  24.34 
 
 
383 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2131  hypothetical protein  21.9 
 
 
354 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  27.97 
 
 
344 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1916  putative lipoprotein  21.51 
 
 
361 aa  43.9  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>