More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8802 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 405 aa  796    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  67.99 
 
 		 436 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  55.22 
 
 		 433 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 		 417 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 		 420 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 414 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  33.91 
 
 		 417 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 430 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  34.89 
 
 		 444 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 416 aa  163  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 		 441 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 450 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 426 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 439 aa  149  8e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 461 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 432 aa  143  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 431 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 		 432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  32.42 
 
 		 408 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  26.25 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 412 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 439 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 413 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 420 aa  133  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  25.95 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  26.5 
 
 		 414 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 451 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 417 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 432 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  20.79 
 
 		 405 aa  100  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  20.79 
 
 		 405 aa  100  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 411 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 435 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4916  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00150833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 432 aa  89.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  22.43 
 
 		 408 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  22.67 
 
 		 408 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  22.2 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  22.43 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  22.67 
 
 		 408 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 		 429 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  22.67 
 
 		 408 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  27.97 
 
 		 415 aa  86.3  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  22.93 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  26.68 
 
 		 408 aa  86.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  22.43 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  22.62 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  22.62 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  28.53 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  28.53 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  29.43 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  28.3 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 524 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 448 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  27.42 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 413 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  25.1 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  25.84 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4635  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 437 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  27.2 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  27.2 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  27.2 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  22.83 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 467 aa  73.2  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  27.14 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  24.47 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  27.14 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  27.14 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  23.28 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0248  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.766226  normal  0.232688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>