More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8792 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 420 aa  829    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  51.92 
 
 		 456 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  48.59 
 
 		 450 aa  362  6e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  50.61 
 
 		 461 aa  361  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  54.3 
 
 		 418 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  46.75 
 
 		 441 aa  358  9.999999999999999e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  46.5 
 
 		 446 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  50.39 
 
 		 452 aa  348  9e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  46.78 
 
 		 457 aa  347  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  43.75 
 
 		 446 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  48.6 
 
 		 432 aa  343  4e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  48.25 
 
 		 413 aa  342  9e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  46.04 
 
 		 414 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  45.57 
 
 		 424 aa  331  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  48.02 
 
 		 428 aa  331  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  47.88 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  45.98 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  47.97 
 
 		 403 aa  326  6e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  43.8 
 
 		 413 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  43.8 
 
 		 413 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  47.3 
 
 		 442 aa  322  6e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  43.54 
 
 		 413 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  46.29 
 
 		 419 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  47.33 
 
 		 419 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  43.64 
 
 		 416 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  46.98 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  43.62 
 
 		 402 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  43.22 
 
 		 412 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  48.8 
 
 		 452 aa  311  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  44.64 
 
 		 405 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  46.52 
 
 		 428 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  44.05 
 
 		 418 aa  306  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  42.29 
 
 		 404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  40.69 
 
 		 405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  43.61 
 
 		 416 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  44.23 
 
 		 425 aa  299  5e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  44.28 
 
 		 476 aa  296  6e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  41.89 
 
 		 431 aa  292  7e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 450 aa  292  7e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  43.16 
 
 		 436 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  39.19 
 
 		 406 aa  289  8e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  42.2 
 
 		 441 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  42.28 
 
 		 417 aa  283  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  42.52 
 
 		 426 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  43.68 
 
 		 429 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  43.26 
 
 		 426 aa  282  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 		 494 aa  278  9e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 509 aa  277  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 450 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  45.25 
 
 		 412 aa  269  7e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  39.09 
 
 		 453 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  39.73 
 
 		 475 aa  258  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  38.7 
 
 		 435 aa  250  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  35.15 
 
 		 426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 491 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  39.23 
 
 		 431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  34.49 
 
 		 412 aa  216  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  37.67 
 
 		 429 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  33.94 
 
 		 430 aa  212  7.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  38.4 
 
 		 418 aa  211  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  37.24 
 
 		 421 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 474 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  34.5 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 474 aa  202  8e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 418 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  31.91 
 
 		 403 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 		 412 aa  193  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3120  major facilitator superfamily MFS_1  38 
 
 		 428 aa  192  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 423 aa  192  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  32.98 
 
 		 410 aa  192  9e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 447 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 436 aa  190  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  34.4 
 
 		 446 aa  189  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 441 aa  189  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 426 aa  189  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3320  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104451  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 413 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  34.55 
 
 		 415 aa  184  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  34.05 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 409 aa  180  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 433 aa  179  7e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 426 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  35.5 
 
 		 414 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 417 aa  176  7e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  34.33 
 
 		 440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  34.19 
 
 		 378 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  33.75 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  30.36 
 
 		 431 aa  171  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 413 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 419 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 432 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  31.18 
 
 		 424 aa  158  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>