169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8760 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  100 
 
 		 140 aa  283  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  38.69 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  36.43 
 
 		 319 aa  87.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  34.62 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  33.33 
 
 		 550 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  35.51 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  33.33 
 
 		 550 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  33.59 
 
 		 321 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  32.85 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  36.03 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  35.56 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  31.75 
 
 		 550 aa  74.7  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  35.04 
 
 		 315 aa  73.9  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  33.33 
 
 		 541 aa  73.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  35.71 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  32.84 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  29.63 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  30.71 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  31.85 
 
 		 548 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  35.43 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  31.2 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  28.8 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  40.31 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  40.31 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  40.31 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  31.69 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  29.92 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  31.78 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  35.71 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  29.63 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  36.89 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  30.89 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  31.78 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  30.37 
 
 		 548 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  39.53 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  33.57 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  31.3 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  27.69 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  32.79 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  36.13 
 
 		 319 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  32.17 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  30.33 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2094  hypothetical protein  32.14 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2366  hypothetical protein  33.86 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  35.56 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  34.91 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  32.28 
 
 		 156 aa  62  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  40.54 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  35.54 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  32.06 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  33.64 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  32.81 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  36.22 
 
 		 312 aa  60.1  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  28.95 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  31.03 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  31.3 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  31.58 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  31.58 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0902  hypothetical protein  30.6 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  24.6 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  32.22 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  34.75 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  33.64 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  32.29 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  34.95 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  29.51 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  33.87 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  32.48 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  33.65 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  29.82 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  32.48 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  33.98 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  35.14 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  32.99 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  26.19 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  28.33 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  29.73 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  35.24 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  32.03 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  33.02 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  26.77 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  28.69 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  30.7 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  28.69 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  33.85 
 
 		 333 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  28.69 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  27.87 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  34.62 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  27.87 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  32.23 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  32.63 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  29.9 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  29.9 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  29.9 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  29.9 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  29.9 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  29.9 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  29.9 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>