More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8718 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  100 
 
 
256 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  58.2 
 
 
255 aa  290  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  58.59 
 
 
255 aa  270  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  47.66 
 
 
269 aa  202  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  42.35 
 
 
252 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.15 
 
 
259 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41 
 
 
264 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  42.8 
 
 
247 aa  168  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.77 
 
 
250 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3321  NmrA family protein  41.63 
 
 
279 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  37.44 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.07 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.26 
 
 
248 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.77 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.42 
 
 
253 aa  125  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.681358  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05170  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35.34 
 
 
251 aa  119  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4049  hypothetical protein  35.98 
 
 
261 aa  115  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000562723  normal  0.100478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  38.22 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  36.12 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  36.16 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  35.56 
 
 
250 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  34.38 
 
 
254 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  34.7 
 
 
246 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  34.53 
 
 
255 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  32.46 
 
 
248 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.98 
 
 
244 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7641  NmrA family protein  35.87 
 
 
251 aa  101  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787849  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5787  NmrA family protein  35.4 
 
 
247 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  35.81 
 
 
251 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  34.88 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  32.74 
 
 
254 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  34.51 
 
 
250 aa  99.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  34.96 
 
 
247 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  29.1 
 
 
302 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  35.4 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  34.23 
 
 
251 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  34.23 
 
 
251 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  34.08 
 
 
250 aa  96.3  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.07 
 
 
482 aa  95.5  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  33.78 
 
 
251 aa  95.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 
258 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1115  NmrA-like  35.71 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.000012808 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 
258 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.716316  hitchhiker  0.0000000415542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5747  NmrA family protein  33.21 
 
 
247 aa  92.8  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
402 aa  92.8  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 
251 aa  92.8  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9038  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  30.94 
 
 
267 aa  92  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  33.21 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4349  NmrA family protein  32.74 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.971724  normal  0.637435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0611  NmrA family protein  31.15 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5436  NmrA family protein  34.82 
 
 
251 aa  89.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2341  NmrA family protein  34.53 
 
 
251 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4584  NmrA family protein  32.89 
 
 
250 aa  89.4  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.907742 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4579  NmrA family protein  32.89 
 
 
250 aa  89.4  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.421298 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2924  NmrA-like  31.84 
 
 
250 aa  89  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3002  NmrA family protein  33.33 
 
 
249 aa  88.6  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.84 
 
 
251 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 
298 aa  87  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
294 aa  87  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  30.88 
 
 
251 aa  86.3  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  33.85 
 
 
244 aa  86.3  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2861  NmrA family protein  30.08 
 
 
266 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 
302 aa  85.5  8e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1322  NmrA family protein  30.12 
 
 
513 aa  85.1  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180223  normal  0.0774954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  32.89 
 
 
311 aa  82  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.66 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1279  hypothetical protein  34.88 
 
 
312 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.62 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.527248  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0991  NmrA family protein  33.19 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6237  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 
505 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00211622  normal  0.83215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2094  NmrA family protein  32.95 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.27 
 
 
249 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40627  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.66 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 
512 aa  78.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.074322  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3222  NmrA family protein  31.42 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.08 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  37.05 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5169  NmrA-like protein  30.87 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269967  hitchhiker  0.0024207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5001  NmrA family protein  31.84 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.66 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7959  NmrA family protein  30.94 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757877  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21160  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  29.39 
 
 
561 aa  73.9  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5460  NmrA family protein  33.18 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13563  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5626  hypothetical protein  32.77 
 
 
515 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20710  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.16 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4374  hypothetical protein  32.43 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.04339  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5307  NmrA family protein  32.33 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27 
 
 
459 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0520232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  40.34 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  31.94 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3565  NmrA family protein  33.6 
 
 
498 aa  72.4  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.803676 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  32.58 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>