151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8653 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8653  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
163 aa  315  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2544  DNA binding domain-containing protein  74.44 
 
 
141 aa  174  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2731  DNA binding domain-containing protein  73.48 
 
 
141 aa  174  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2823  DNA binding domain protein, excisionase family  68.85 
 
 
132 aa  158  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9032  molybdenum-pterin binding protein  69.67 
 
 
136 aa  155  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424938  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2560  DNA binding domain protein, excisionase family  63.78 
 
 
133 aa  149  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151645  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2691  excisionase family DNA binding domain-containing protein  64.52 
 
 
127 aa  145  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1070  DNA binding domain-containing protein  61.11 
 
 
130 aa  137  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1951  DNA binding domain protein, excisionase family  60.33 
 
 
132 aa  130  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400449  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3484  DNA binding domain protein, excisionase family  57.02 
 
 
136 aa  130  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3984  TOBE  59.2 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0770501  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1230  TOBE domain protein  61.79 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3749  TOBE domain-containing protein  54.47 
 
 
136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4972  DNA binding domain protein, excisionase family  59.35 
 
 
131 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2041  DNA binding domain-containing protein  59.35 
 
 
132 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0046  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  57.6 
 
 
134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0055  DNA binding domain-containing protein  57.6 
 
 
134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159209  normal  0.0252728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0036  DNA binding domain-containing protein  57.6 
 
 
134 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2907  TOBE domain protein  57.38 
 
 
135 aa  120  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251245  hitchhiker  0.0000128303 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1752  DNA binding domain protein, excisionase family  55.37 
 
 
133 aa  119  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.718089  decreased coverage  0.00260274 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4178  DNA binding domain, excisionase family  56 
 
 
135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180045  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1854  TOBE domain protein  55 
 
 
133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316057  hitchhiker  0.00765451 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18110  DNA-binding protein, excisionase family  51.85 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059521  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5281  DNA binding domain-containing protein  53.6 
 
 
135 aa  113  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113693  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2807  TOBE domain protein  55.17 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4510  DNA binding domain protein, excisionase family  52.85 
 
 
133 aa  107  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3858  DNA binding domain-containing protein  57.02 
 
 
132 aa  105  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179703  normal  0.0579791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2539  DNA binding domain-containing protein  56.2 
 
 
134 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420071  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34150  molybdenum-pterin binding domain protein  54.76 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264153  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3465  DNA binding domain protein, excisionase family  43.75 
 
 
138 aa  95.5  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215195  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  37.9 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  45.16 
 
 
72 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3768  TOBE domain protein  49.21 
 
 
69 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  37.66 
 
 
140 aa  51.2  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  40.32 
 
 
195 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  47.62 
 
 
69 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  36.36 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  40.79 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1085  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  38.46 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252098  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1565  molybdenum-pterin binding  38.46 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.239605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1541  TOBE domain-containing protein  38.46 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00697531  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4707  molybdenum-pterin binding protein  38.46 
 
 
71 aa  48.5  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322393  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  40.51 
 
 
177 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1839  molybdenum-pterin binding protein  40 
 
 
102 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  40.62 
 
 
266 aa  48.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1236  molybdenum-pterin binding protein, putative  40 
 
 
71 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1993  molybdenum-pterin binding protein  40 
 
 
71 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1466  molybdenum-pterin binding  38.46 
 
 
71 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0340252  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1722  putative molybdenum-pterin binding protein  40 
 
 
71 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0412  TOBE domain protein  46.03 
 
 
69 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.288913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0379  putative molybdenum-pterin binding protein  40 
 
 
71 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0391614  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1824  molybdenum-pterin binding protein  40 
 
 
71 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0782  putative molybdenum-pterin binding protein  40 
 
 
71 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1667  TOBE domain-containing protein  38.46 
 
 
71 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000784196  normal  0.211047 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1487  TOBE domain-containing protein  38.46 
 
 
71 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1576  TOBE domain protein  47.62 
 
 
69 aa  48.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2490  molybdenum-pterin binding protein  38.46 
 
 
71 aa  47.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
270 aa  47.4  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2652  TOBE domain protein  44.44 
 
 
69 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.57185  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0871  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  36.27 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180666  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  41.67 
 
 
201 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  34.78 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2845  TOBE domain protein  42.86 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2622  TOBE domain-containing protein  42.86 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.142109 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2498  molybdenum-pterin binding protein, putative  36.92 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  53.85 
 
 
201 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  37.21 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1646  TOBE domain-containing protein  36.92 
 
 
71 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285785  normal  0.27143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4442  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  41.54 
 
 
68 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.973007  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3712  TOBE domain protein  47.62 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  38.64 
 
 
278 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
268 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2790  TOBE domain-containing protein  31.25 
 
 
438 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5868  molybdenum-pterin binding protein (Mop)  43.08 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5517  TOBE domain protein  47.62 
 
 
69 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.520442  normal  0.766178 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  39.39 
 
 
270 aa  44.7  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0416  TOBE domain-containing protein  46.03 
 
 
69 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  37.18 
 
 
141 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1804  ModE family transcriptional regulator  32.47 
 
 
139 aa  44.7  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00273246  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 
267 aa  44.3  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  44.44 
 
 
142 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  37.18 
 
 
141 aa  44.3  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  32.31 
 
 
68 aa  43.9  0.0009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  40.62 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  46.67 
 
 
203 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  46.67 
 
 
203 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  37.18 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0168  TOBE domain protein  40.32 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0057717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0855  molybdenum-pterin binding protein  46.03 
 
 
69 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2228  TOBE domain protein  39.06 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00741747  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  32.05 
 
 
269 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  35.37 
 
 
209 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2166  TOBE domain protein  39.06 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  41.27 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2025  DNA binding domain-containing protein  55.88 
 
 
206 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  31.82 
 
 
378 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0265  TOBE domain-containing protein  31.67 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4971  TOBE domain-containing protein  31.67 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0185371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3265  TOBE domain protein  30.53 
 
 
142 aa  43.9  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36964  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1747  TOBE domain protein  33.85 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>