186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8611 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5420  peptidase M28  77.38 
 
 		 759 aa  1140    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  100 
 
 		 764 aa  1505    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4964  hypothetical protein  64.16 
 
 		 453 aa  569  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0874599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0633  FAD dependent oxidoreductase  67.92 
 
 		 424 aa  549  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5388  hypothetical protein  56.68 
 
 		 497 aa  490  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.836925 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3656  FAD dependent oxidoreductase  59.96 
 
 		 468 aa  486  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4717  FAD dependent oxidoreductase  56.64 
 
 		 476 aa  481  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0385  FAD dependent oxidoreductase  58.86 
 
 		 468 aa  481  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2281  FAD dependent oxidoreductase  57.32 
 
 		 494 aa  477  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.901195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2664  FAD dependent oxidoreductase  56.53 
 
 		 469 aa  473  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.312794 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14630  predicted flavoprotein involved in K+ transport  57.3 
 
 		 461 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0215  FAD dependent oxidoreductase  55.72 
 
 		 461 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0074  FAD dependent oxidoreductase  60.77 
 
 		 405 aa  462  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0225  FAD dependent oxidoreductase  57.11 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0491  putative secreted protein  53.23 
 
 		 442 aa  449  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.557895  hitchhiker  0.0044003 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1915  putative secreted protein  58.84 
 
 		 451 aa  452  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20640  predicted flavoprotein involved in K+ transport  56.32 
 
 		 445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0518  putative secreted protein  58.07 
 
 		 445 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312569  hitchhiker  0.00121431 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31150  predicted flavoprotein involved in K+ transport  55.08 
 
 		 446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2824  putative secreted protein  51.96 
 
 		 434 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000320081  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3968  putative secreted protein  53.86 
 
 		 471 aa  405  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4494  FAD dependent oxidoreductase  48.28 
 
 		 497 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3218  secreted protein  51.96 
 
 		 441 aa  392  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4433  putative secreted protein  49.77 
 
 		 456 aa  388  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5580  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  50.59 
 
 		 454 aa  372  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.216169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4970  aminopeptidase-like protein  54.82 
 
 		 442 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  30.88 
 
 		 1103 aa  87  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  29.74 
 
 		 574 aa  80.1  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  27.57 
 
 		 323 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  29.07 
 
 		 319 aa  67  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  27.57 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  28.57 
 
 		 346 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  27.41 
 
 		 346 aa  62.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  27.34 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  30.13 
 
 		 447 aa  62  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1464  Flavin-containing monooxygenase  31.63 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  30.59 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  24.2 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  27.35 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  28.16 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  27.05 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  27.03 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0815  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  28.17 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  30.1 
 
 		 598 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  24.34 
 
 		 322 aa  60.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  27.21 
 
 		 398 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  26.62 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  33.97 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  27.36 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  28.22 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  23.64 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0446  HI0933 family protein  23.53 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  33.33 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  26.64 
 
 		 333 aa  57.4  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1280  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.31 
 
 		 330 aa  57  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  28 
 
 		 416 aa  57.4  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  31.18 
 
 		 346 aa  56.2  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  24.23 
 
 		 424 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  23.91 
 
 		 325 aa  55.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0003  peptidase M28  27.38 
 
 		 319 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  26.04 
 
 		 352 aa  55.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  24.35 
 
 		 341 aa  55.5  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 642 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  29.03 
 
 		 674 aa  55.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 642 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  30.17 
 
 		 557 aa  55.1  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.94 
 
 		 361 aa  55.1  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  27.96 
 
 		 512 aa  54.7  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  35 
 
 		 625 aa  55.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4968  putative flavoprotein  28.07 
 
 		 357 aa  54.7  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  25.66 
 
 		 353 aa  54.7  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  31.91 
 
 		 394 aa  54.3  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.38 
 
 		 377 aa  54.3  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  28.74 
 
 		 318 aa  54.3  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  26.15 
 
 		 462 aa  54.3  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  30.17 
 
 		 539 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  33.33 
 
 		 518 aa  53.5  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  29.21 
 
 		 555 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.88 
 
 		 358 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  31.47 
 
 		 775 aa  53.5  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  26.92 
 
 		 420 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  31.67 
 
 		 347 aa  53.5  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.25 
 
 		 369 aa  52.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  31.46 
 
 		 552 aa  52.8  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  31.49 
 
 		 558 aa  52.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1217  hypothetical protein  24.69 
 
 		 327 aa  52.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000500941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  31.49 
 
 		 558 aa  52.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2494  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.51 
 
 		 335 aa  51.6  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  35.11 
 
 		 584 aa  52  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2182  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.12 
 
 		 326 aa  51.2  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  34.86 
 
 		 282 aa  51.2  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  29.63 
 
 		 339 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  27.75 
 
 		 536 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  27.75 
 
 		 571 aa  51.2  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  30.94 
 
 		 558 aa  50.8  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  30.16 
 
 		 291 aa  50.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  27.75 
 
 		 535 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  20.64 
 
 		 361 aa  50.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3388  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  22.31 
 
 		 352 aa  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  30.43 
 
 		 479 aa  50.4  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>