14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8558 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8558  replication initiator protein  100 
 
 
543 aa  1115    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404857  hitchhiker  0.00106122 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0041  hypothetical protein  60.99 
 
 
552 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5326  replication initiator protein  58.6 
 
 
572 aa  575  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5291  hypothetical protein  53.79 
 
 
568 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.872454  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6307  replication initiator protein  57.98 
 
 
572 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1030  hypothetical protein  58.63 
 
 
572 aa  566  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5539  replication initiator protein  58.63 
 
 
573 aa  564  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95807  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0150  hypothetical protein  52.79 
 
 
577 aa  560  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0693  hypothetical protein  53.3 
 
 
550 aa  558  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.270288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5522  replication initiator protein  57.41 
 
 
569 aa  551  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0195674  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0922  hypothetical protein  47.69 
 
 
527 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0404  hypothetical protein  57.52 
 
 
476 aa  464  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6362  hypothetical protein  45.54 
 
 
555 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2945  hypothetical protein  64.29 
 
 
56 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>