More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8553 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 242 aa  488  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 246 aa  204  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  48.72 
 
 		 244 aa  204  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5286  transcriptional regulator, GntR family  46.47 
 
 		 243 aa  198  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  45 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  43.57 
 
 		 238 aa  191  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0718  putative transcriptional regulator, GntR family  43.15 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 253 aa  98.6  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0337  GntR family transcriptional regulator  58.11 
 
 		 105 aa  96.7  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 244 aa  92  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  30.24 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  31.69 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  27.71 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  28.69 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  26.02 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  28.63 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1078  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358733  hitchhiker  0.00355085 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3327  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3762  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0146  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2925  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  32.46 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.608421  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  30.98 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0165  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.899806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0812  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  30.14 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  27.97 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  26.55 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  29.96 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  31.69 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  26.64 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  27.85 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  27.85 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4635  transcriptional regulator, GntR family  25.97 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000503298  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 269 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  27.97 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  27.4 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  25.83 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0011  transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  27.69 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3693  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  30.45 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189097  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4032  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  30.45 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0420  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.330179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0456  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.69 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4822  transcriptional regulator, GntR family  27.35 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3559  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  30.84 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  28.21 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  26.09 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  30 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4438  transcriptional regulator, GntR family  27.19 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1926  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4063  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  27.85 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1001  putative transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2890  transcriptional regulator, GntR family  27.09 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  25.54 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>