46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8476 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8476  protein of unknown function DUF690  100 
 
 
470 aa  910    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1440  hypothetical protein  34.86 
 
 
467 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.1984  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0941  hypothetical protein  33.81 
 
 
472 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15053  normal  0.447115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2228  hypothetical protein  34.31 
 
 
458 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359411  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0477  hypothetical protein  30.53 
 
 
479 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8522  protein of unknown function DUF690  30.5 
 
 
510 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.013435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0986  hypothetical protein  29.44 
 
 
453 aa  153  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8088  hypothetical protein  31.93 
 
 
483 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3150  protein of unknown function DUF690  30.54 
 
 
488 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0674  hypothetical protein  30.19 
 
 
464 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.340047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1208  protein of unknown function DUF690  30.24 
 
 
481 aa  127  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0396  hypothetical protein  27.56 
 
 
448 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.769323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0609  protein of unknown function DUF690  27.1 
 
 
467 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4812  protein of unknown function DUF690  29.05 
 
 
459 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0399688  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4839  hypothetical protein  28.3 
 
 
454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000509999 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3203  protein of unknown function DUF690  27.93 
 
 
459 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.161915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0690  hypothetical protein  24.35 
 
 
487 aa  96.3  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.335063  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10290  hypothetical protein  27.33 
 
 
538 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.225236  normal  0.597294 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6576  protein of unknown function DUF690  23.26 
 
 
540 aa  79.7  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7885  protein of unknown function DUF690  26.32 
 
 
465 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0519943  normal  0.0107564 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13487  hypothetical protein  28.95 
 
 
482 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0376841  normal  0.0257137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0328  hypothetical protein  26.87 
 
 
512 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0953892  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3367  protein of unknown function DUF690  28.9 
 
 
472 aa  76.6  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5778  hypothetical protein  29.68 
 
 
505 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981226  normal  0.352766 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5959  hypothetical protein  25.74 
 
 
504 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5556  hypothetical protein  25.74 
 
 
504 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1444  hypothetical protein  29.39 
 
 
461 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129092  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0412  hypothetical protein  27.91 
 
 
510 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.218055 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0371  hypothetical protein  29.44 
 
 
516 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0381  hypothetical protein  29.44 
 
 
516 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3295  protein of unknown function DUF690  27.01 
 
 
496 aa  59.3  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061282  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13904  hypothetical protein  28.57 
 
 
480 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1123  hypothetical protein  27.7 
 
 
485 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1140  hypothetical protein  27.7 
 
 
457 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1150  hypothetical protein  27.7 
 
 
457 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4962  hypothetical protein  26.6 
 
 
453 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250808  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0360  hypothetical protein  28.93 
 
 
516 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5462  hypothetical protein  26.26 
 
 
486 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309937  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13930  hypothetical protein  25.9 
 
 
495 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.906406  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0073  hypothetical protein  26.44 
 
 
495 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0449137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0772  hypothetical protein  25.55 
 
 
493 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0055  hypothetical protein  25.25 
 
 
491 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00921629 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0074  hypothetical protein  25.25 
 
 
491 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0065  hypothetical protein  25.25 
 
 
491 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0308  hypothetical protein  30.88 
 
 
482 aa  50.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00549191  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11813  hypothetical protein  23.33 
 
 
506 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.320654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>