161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8392 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  100 
 
 
537 aa  1088    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  44.33 
 
 
506 aa  398  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  46.43 
 
 
527 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  43.69 
 
 
515 aa  391  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  41.77 
 
 
521 aa  382  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  41.18 
 
 
541 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  42.16 
 
 
542 aa  374  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  40.56 
 
 
524 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  41.64 
 
 
508 aa  369  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  41.7 
 
 
545 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  40.66 
 
 
521 aa  365  1e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  44.18 
 
 
485 aa  356  5.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  39.52 
 
 
518 aa  351  2e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  41.08 
 
 
500 aa  350  3e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  39.75 
 
 
507 aa  350  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  40.47 
 
 
525 aa  338  9.999999999999999e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  39.01 
 
 
522 aa  336  7.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  42.13 
 
 
495 aa  334  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  40.12 
 
 
521 aa  323  7e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  39.63 
 
 
515 aa  320  3e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  37.87 
 
 
523 aa  318  2e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  40.34 
 
 
511 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  40.34 
 
 
511 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  40.34 
 
 
511 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  39.13 
 
 
540 aa  310  4e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  37.64 
 
 
525 aa  304  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  36.64 
 
 
546 aa  302  9e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  38.73 
 
 
542 aa  298  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  38.84 
 
 
520 aa  295  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  38.16 
 
 
522 aa  292  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  38.61 
 
 
495 aa  291  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  38.76 
 
 
518 aa  289  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  38.34 
 
 
538 aa  283  5.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  37.58 
 
 
505 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  36.55 
 
 
516 aa  280  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  36.84 
 
 
533 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  36.84 
 
 
508 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  36.84 
 
 
508 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  37.82 
 
 
520 aa  271  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  37.84 
 
 
551 aa  256  8e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  36.1 
 
 
505 aa  251  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  35.06 
 
 
557 aa  231  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  31.41 
 
 
476 aa  229  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  34.85 
 
 
535 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  33.7 
 
 
535 aa  220  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  31.23 
 
 
564 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  32.4 
 
 
643 aa  207  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  31.54 
 
 
506 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  30.41 
 
 
504 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  29.6 
 
 
504 aa  201  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  31.19 
 
 
530 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  30.13 
 
 
499 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  32.4 
 
 
571 aa  188  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  30.25 
 
 
544 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  32.54 
 
 
547 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  31.17 
 
 
505 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  31.33 
 
 
532 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  32.99 
 
 
551 aa  184  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  31.23 
 
 
532 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  31.71 
 
 
522 aa  177  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  33.54 
 
 
504 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  26.48 
 
 
597 aa  173  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  29.87 
 
 
555 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  30.36 
 
 
539 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  31.21 
 
 
597 aa  172  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  28.08 
 
 
505 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  28.51 
 
 
499 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  32.72 
 
 
521 aa  171  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  33.12 
 
 
484 aa  170  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  29.75 
 
 
556 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  30.14 
 
 
508 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  31.21 
 
 
527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  28.78 
 
 
514 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  30.21 
 
 
520 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  29.57 
 
 
505 aa  161  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  26.3 
 
 
478 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  26.11 
 
 
542 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  29.54 
 
 
546 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  27.22 
 
 
515 aa  153  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  35.1 
 
 
613 aa  153  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  30.74 
 
 
536 aa  151  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  37.94 
 
 
300 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  25.64 
 
 
486 aa  150  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  28.01 
 
 
494 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3994  TAP domain protein  29.76 
 
 
557 aa  143  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  28.78 
 
 
524 aa  143  9e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 
486 aa  141  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  29.44 
 
 
493 aa  140  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  27.94 
 
 
518 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  25.65 
 
 
750 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3544  TAP domain protein  32.49 
 
 
524 aa  131  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000370838  hitchhiker  0.00997148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  27.24 
 
 
559 aa  128  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05429  conserved hypothetical protein  26.53 
 
 
600 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00467317  normal  0.0133715 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08498  proteinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01350)  26.1 
 
 
678 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.726549  normal  0.616517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  26.91 
 
 
566 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2785  TAP domain protein  35.29 
 
 
480 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000127217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  26.27 
 
 
459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02580  alpha/beta hydrolase family protein  35.62 
 
 
623 aa  115  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.978734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1577  TAP domain protein  29.97 
 
 
514 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  25.11 
 
 
475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>