37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8385 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  100 
 
 		 415 aa  835    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  33.54 
 
 		 432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  28.67 
 
 		 401 aa  109  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2756  membrane protein-like protein  27.75 
 
 		 427 aa  109  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2089  membrane protein  28.42 
 
 		 409 aa  93.2  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2072  membrane protein-like protein  26.07 
 
 		 419 aa  90.1  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000107578  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4888  membrane protein-like protein  29.51 
 
 		 497 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05220  hypothetical protein  23.46 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4561  membrane protein  23.98 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5223  membrane protein-like protein  27.88 
 
 		 348 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1894  membrane protein-like protein  25 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  26.59 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  25.65 
 
 		 355 aa  62  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1438  membrane protein-like protein  25.79 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2147  membrane protein-like protein  24 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0231192  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0515  hypothetical protein  27.84 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3085  membrane protein-like protein  27.05 
 
 		 373 aa  54.3  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157468 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  25.85 
 
 		 431 aa  53.5  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0989  hypothetical protein  28.39 
 
 		 385 aa  53.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  27.11 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01600  hypothetical protein  27.68 
 
 		 389 aa  51.6  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07150  predicted membrane protein  28.57 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.269027 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4060  membrane protein-like protein  26.2 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6914  hypothetical protein  30 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1021  protein of unknown function DUF939  23.96 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1355  protein of unknown function DUF939  21.53 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0479  hypothetical protein  23.44 
 
 		 347 aa  47.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0385  hypothetical protein  21.33 
 
 		 347 aa  46.6  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0370  hypothetical protein  21.33 
 
 		 347 aa  46.6  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.168954  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1427  hypothetical protein  24.8 
 
 		 328 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2373  membrane protein-like protein  29.86 
 
 		 378 aa  45.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2854  protein of unknown function DUF939  24.59 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150016  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  24.19 
 
 		 363 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0274  membrane protein-like protein  27.33 
 
 		 399 aa  43.5  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.024335 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0445  hypothetical protein  25.52 
 
 		 369 aa  43.1  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.379085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3973  hypothetical protein  29.94 
 
 		 341 aa  43.1  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215582  hitchhiker  0.00962889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2889  hypothetical protein  28.07 
 
 		 740 aa  42.7  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.777719  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>