242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8354 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8354  Proline dehydrogenase  100 
 
 
309 aa  629  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1081  Proline dehydrogenase  67.7 
 
 
307 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962352  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0078  Proline dehydrogenase  61.69 
 
 
308 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0480  L-proline dehydrogenase  60.53 
 
 
316 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0342  proline dehydrogenase  62.01 
 
 
305 aa  364  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0992788  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0409  proline dehydrogenase  62.34 
 
 
306 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5760  Proline dehydrogenase  59.09 
 
 
306 aa  358  9e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0248  L-proline dehydrogenase  56.65 
 
 
317 aa  354  1e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529478  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0434  L-proline dehydrogenase  60.14 
 
 
311 aa  347  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24480  L-proline dehydrogenase  54.52 
 
 
319 aa  344  1e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4460  Proline dehydrogenase  58.63 
 
 
306 aa  343  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4025  L-proline dehydrogenase  54.52 
 
 
318 aa  339  4e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4100  L-proline dehydrogenase  54.52 
 
 
318 aa  339  4e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422146  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4255  L-proline dehydrogenase  54.52 
 
 
318 aa  339  4e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3097  proline dehydrogenase  56.17 
 
 
308 aa  333  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.274193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11212  proline dehydrogenase  54.63 
 
 
329 aa  323  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0207588  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1511  proline dehydrogenase  54.1 
 
 
302 aa  322  7e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02730  L-proline dehydrogenase  54.22 
 
 
308 aa  317  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  54.61 
 
 
311 aa  314  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4525  proline dehydrogenase  53.87 
 
 
320 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0201  Proline dehydrogenase  52.23 
 
 
317 aa  310  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4483  Proline dehydrogenase  54.07 
 
 
306 aa  308  5.9999999999999995e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0646  Proline dehydrogenase  53.57 
 
 
308 aa  305  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1295  Proline dehydrogenase  52.44 
 
 
317 aa  292  5e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2823  L-proline dehydrogenase  54.42 
 
 
309 aa  278  8e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0088  L-proline dehydrogenase  48.05 
 
 
308 aa  270  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0599  Proline dehydrogenase  39.87 
 
 
306 aa  236  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0183  Proline dehydrogenase  40.7 
 
 
290 aa  206  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3090  Proline dehydrogenase  37.13 
 
 
305 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4838  proline dehydrogenase  35.48 
 
 
305 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2939  Proline dehydrogenase  35.83 
 
 
305 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4879  proline dehydrogenase family protein  35.48 
 
 
305 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0091  proline dehydrogenase family protein  35.48 
 
 
305 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5253  proline dehydrogenase family protein  35.48 
 
 
305 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0498834  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5153  proline dehydrogenase family protein  35.16 
 
 
305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5148  proline dehydrogenase family protein  35.16 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4721  proline dehydrogenase  35.16 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4736  proline dehydrogenase  35.16 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5159  proline dehydrogenase family protein  35.16 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5121  proline dehydrogenase family protein  35.16 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6745  Proline dehydrogenase  41.22 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.989214  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3600  proline dehydrogenase  35.22 
 
 
305 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2640  Proline dehydrogenase  38.11 
 
 
307 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1338  L-proline dehydrogenase  36.98 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0851  proline dehydrogenase  38.39 
 
 
310 aa  189  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.435625  normal  0.094276 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2524  Proline dehydrogenase  37.54 
 
 
307 aa  186  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.30854  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0662  Proline dehydrogenase  38.91 
 
 
331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3124  Proline dehydrogenase  38.51 
 
 
307 aa  179  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206513  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2428  proline dehydrogenase  40.36 
 
 
360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.342567 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2923  L-proline dehydrogenase  38.87 
 
 
306 aa  169  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0351  Proline dehydrogenase  36.4 
 
 
279 aa  159  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0346031  normal  0.177758 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4054  Proline dehydrogenase  37.68 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1324  proline dehydrogenase  30.74 
 
 
333 aa  149  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.26467  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0346  proline dehydrogenase  32.72 
 
 
318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1854  proline dehydrogenase  29.07 
 
 
333 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1819  proline dehydrogenase  29.07 
 
 
333 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2465  proline dehydrogenase  34.16 
 
 
319 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0949  Proline dehydrogenase  34.67 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1500  L-proline dehydrogenase  34.12 
 
 
306 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49139  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1107  Proline dehydrogenase  34.75 
 
 
277 aa  133  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000219006  normal  0.0483795 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1150  Proline dehydrogenase  34.25 
 
 
290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.906847  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2929  Proline dehydrogenase  33.57 
 
 
278 aa  122  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1366  proline dehydrogenase superfamily protein  30.94 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5008  proline dehydrogenase  29.92 
 
 
271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3332  proline dehydrogenase  31.65 
 
 
323 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.81 
 
 
1001 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0496  Proline dehydrogenase  33.69 
 
 
279 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.19 
 
 
993 aa  105  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3209  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  31.29 
 
 
1001 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.66 
 
 
991 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0054  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.03 
 
 
1003 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3512  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.7 
 
 
1003 aa  97.4  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2146  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.55 
 
 
1013 aa  95.9  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  28.27 
 
 
996 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2411  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.05 
 
 
1004 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0350749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3395  proline dehydrogenase/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.18 
 
 
1004 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1806  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.75 
 
 
1004 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285483 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.57 
 
 
1006 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3142  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.81 
 
 
990 aa  90.9  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.02 
 
 
991 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.02 
 
 
991 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.63 
 
 
993 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1871  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.54 
 
 
1002 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00392052  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1378  Aldehyde Dehydrogenase  28.14 
 
 
975 aa  77.4  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0715  aldehyde dehydrogenase  27.73 
 
 
1028 aa  73.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2812  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.28 
 
 
1032 aa  72.8  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.616063  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0308  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.77 
 
 
1085 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.048295 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0555  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.11 
 
 
1055 aa  70.1  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.637208  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0656  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.48 
 
 
1236 aa  69.3  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2702  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.4 
 
 
1050 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2311  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.89 
 
 
1221 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07096  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.24 
 
 
1043 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4428  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.32 
 
 
1040 aa  67  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001017  proline dehydrogenase (Proline oxidase)/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.32 
 
 
1043 aa  67  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135188  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0570  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.99 
 
 
1241 aa  66.6  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01017  fused DNA-binding transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.62 
 
 
1320 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01024  hypothetical protein  28.62 
 
 
1320 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2037  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.59 
 
 
1323 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.851494 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3846  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.93 
 
 
1227 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2268  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.59 
 
 
1323 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>