122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8339 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  100 
 
 		 74 aa  149  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  91.23 
 
 		 67 aa  107  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  89.47 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  87.72 
 
 		 67 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  84.21 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  78.26 
 
 		 69 aa  100  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  82.46 
 
 		 66 aa  98.6  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  82.14 
 
 		 78 aa  96.7  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0343  DNA binding domain-containing protein  81.03 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  71.43 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6742  DNA binding domain protein, excisionase family  74.24 
 
 		 70 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4589  DNA binding domain protein, excisionase family  83.64 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  75 
 
 		 71 aa  92.8  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  69.35 
 
 		 77 aa  92  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5764  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  77.97 
 
 		 69 aa  92.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  75.86 
 
 		 70 aa  92  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  71.19 
 
 		 84 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 67 aa  88.6  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  72.13 
 
 		 82 aa  85.5  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  78.43 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  62.69 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  62.69 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  62.69 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  75 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  64.18 
 
 		 78 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  62.26 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  61.4 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1754  DNA binding domain-containing protein  42.59 
 
 		 79 aa  52.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.988357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18850  DNA-binding protein, excisionase family  40 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0755115 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 305 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 315 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1068  DNA binding domain-containing protein  54.17 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  45.65 
 
 		 306 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  45.65 
 
 		 306 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  45.65 
 
 		 306 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  45.65 
 
 		 315 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  43.48 
 
 		 315 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  43.48 
 
 		 315 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  40.38 
 
 		 308 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1014  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174874  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  41.51 
 
 		 317 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0057  DNA binding domain protein, excisionase family  37.04 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  43.48 
 
 		 306 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  45.65 
 
 		 306 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4561  DNA binding domain protein, excisionase family  38.18 
 
 		 335 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000373649  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0183  excisionase/Xis, DNA-binding  40 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.50459 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0187  DNA binding domain-containing protein  45.65 
 
 		 306 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  45.65 
 
 		 306 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0830  DNA binding domain protein, excisionase family  51.16 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1923  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151509  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0019  DNA binding domain protein, excisionase family  41.82 
 
 		 326 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  37.74 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0399  DNA binding domain protein  47.62 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0810  DNA binding domain-containing protein  34.69 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0378139 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  34.69 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  46.15 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.126715 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1158  DNA binding domain protein, excisionase family  38.18 
 
 		 320 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  46.15 
 
 		 64 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  46.15 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1818  DNA binding domain protein, excisionase family  40.74 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2677  DNA binding domain protein, excisionase family  37.29 
 
 		 248 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000367572  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0403  DNA binding domain-containing protein  42.22 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00109148  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0475  DNA binding domain protein, excisionase family  39.13 
 
 		 59 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1373  DNA binding domain protein, excisionase family  37.04 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.150452  normal  0.608201 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1600  excisionase/Xis, DNA-binding protein  43.4 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.607243  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2195  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0975  DNA binding domain-containing protein  37.93 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5834  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0912  excision promoter, Xis  39.66 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.5021 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1498  DNA binding domain protein, excisionase family  30 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  39.58 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1452  DNA binding domain protein, excisionase family  38 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0405  excisionase/Xis, DNA-binding  41.3 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.831547 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0771  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2760  putative transcriptional regulator  33.93 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466966 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2702  DNA binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 71 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265646  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4226  DNA binding domain-containing protein  55.56 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.89473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2433  DNA binding domain protein, excisionase family  38.89 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0216773 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1213  DNA binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134195  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0230  DNA binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.016519 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3430  putative transcriptional regulator  35.09 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 57 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5521  DNA binding domain-containing protein  40.43 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00471418  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04063  VrlI like protein  30.51 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0025  DNA binding domain protein, excisionase family  39.13 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.917253  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1057  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 72 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0972147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2463  DNA binding domain-containing protein  36.96 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000388448  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0700  DNA binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000271881  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2501  Prophage CP4-57 regulatory  37.04 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2321  DNA binding domain protein, excisionase family  35.19 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.842741  hitchhiker  0.0000766281 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2142  excisionase/Xis, DNA-binding  40 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.276898 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1172  phage transcriptional regulator, AlpA  32.65 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0554  phage transcriptional regulator, AlpA  32.76 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3682  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  32.65 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5325  DNA binding domain-containing protein  44.68 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0330031 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>