19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8334 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8334  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  609  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0824373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4877  AAA ATPase  33.94 
 
 		 856 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0492  hypothetical protein  33.88 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0964  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0063713  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4575  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.81 
 
 		 513 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7214  hypothetical protein  32.83 
 
 		 246 aa  89  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.906304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1332  hypothetical protein  36.55 
 
 		 751 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0324065  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0398  hypothetical protein  34.95 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6990  hypothetical protein  35.96 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0692886  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1230  hypothetical protein  28.48 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1992  hypothetical protein  28.72 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000239593  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  30.24 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1607  hypothetical protein  27.81 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  28.64 
 
 		 524 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4519  hypothetical protein  28.8 
 
 		 239 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0633  hypothetical protein  33.1 
 
 		 209 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1166  hypothetical protein  28.15 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137504  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5510  hypothetical protein  23.2 
 
 		 205 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242777  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26890  hypothetical protein  26.98 
 
 		 309 aa  42.4  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>