10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8297 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8297  hypothetical protein  100 
 
 		 509 aa  1043    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0035  putative integral membrane protein  25.57 
 
 		 500 aa  114  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7297  putative integral membrane protein  27.89 
 
 		 500 aa  103  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0189864 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0819  hypothetical protein  25.28 
 
 		 486 aa  95.5  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06750  hypothetical protein  24.69 
 
 		 487 aa  87.4  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00170  putative integral membrane protein  24.94 
 
 		 487 aa  82.4  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8940  putative integral membrane protein  23.98 
 
 		 519 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0680972  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5434  hypothetical protein  25.73 
 
 		 513 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0443  hypothetical protein  23.62 
 
 		 487 aa  68.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.13 
 
 		 608 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>