More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8227 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 165 aa  330  5e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  57.81 
 
 		 183 aa  140  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  55.94 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0067  XRE family transcriptional regulator  62.39 
 
 		 233 aa  134  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  57.26 
 
 		 277 aa  133  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  54.35 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  57.72 
 
 		 325 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  52 
 
 		 191 aa  128  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 176 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 182 aa  127  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  62.96 
 
 		 128 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  61.26 
 
 		 156 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  54.2 
 
 		 145 aa  124  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  55.12 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 191 aa  121  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  54.63 
 
 		 140 aa  121  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  58.04 
 
 		 128 aa  120  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  56.64 
 
 		 141 aa  120  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  52.17 
 
 		 162 aa  110  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  49.63 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  46.79 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  44.04 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  41.18 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 252 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  45.07 
 
 		 84 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  42.11 
 
 		 204 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 223 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0336  DNA-binding protein, putative  40.85 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00628261  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  28.44 
 
 		 186 aa  52  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 186 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 197 aa  52  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 181 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 186 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 186 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 186 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  34.21 
 
 		 186 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_277  DNA-binding protein  40.85 
 
 		 133 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000765574  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 250 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0315  helix-turn-helix domain-containing protein  40.85 
 
 		 133 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138688  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0188  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 229 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.054457 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  48.08 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 201 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0772  putative transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1750  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00805015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  40.38 
 
 		 187 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 191 aa  48.5  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  40.38 
 
 		 187 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 187 aa  48.5  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  34.23 
 
 		 190 aa  48.5  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  34.26 
 
 		 190 aa  48.5  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  40.38 
 
 		 187 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  40.38 
 
 		 187 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 71 aa  48.1  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 228 aa  48.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 71 aa  48.1  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1953  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  42.11 
 
 		 236 aa  47.8  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 101 aa  47.8  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 223 aa  47.8  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  38.33 
 
 		 194 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  42.11 
 
 		 179 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  42.11 
 
 		 179 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  42.11 
 
 		 179 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  42.11 
 
 		 236 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 99 aa  47.4  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  42.11 
 
 		 179 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  42.11 
 
 		 179 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  42.11 
 
 		 179 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2037  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 154 aa  47.4  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00457383  normal  0.0572202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 245 aa  47.4  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  33.73 
 
 		 255 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  40.38 
 
 		 224 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0893  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00171565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2581  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 71 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321044  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2614  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.105443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2662  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 128 aa  47.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2854  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770075  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2734  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00297691  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  37.5 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  41.67 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>