More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8187 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
233 aa  465  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  56.09 
 
 
250 aa  264  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08960  glycosyl transferase  56.96 
 
 
245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  54.15 
 
 
243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2568  glycosyl transferase family 2  57.21 
 
 
250 aa  248  7e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.238514  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2681  glycosyl transferase family protein  54.35 
 
 
249 aa  248  8e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0123554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  41.05 
 
 
232 aa  201  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0571  glycosyltransferase ycbB  38.67 
 
 
234 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.50645  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
229 aa  169  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0090  glycosyl transferase family 2  40.61 
 
 
252 aa  168  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1440  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  39.22 
 
 
238 aa  167  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000177815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5607  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 
242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  36.4 
 
 
242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  36.4 
 
 
242 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  36.16 
 
 
227 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  42.61 
 
 
245 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1421  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.74 
 
 
243 aa  150  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000839573  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  42.17 
 
 
245 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  42.61 
 
 
245 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0213  glycosyltransferase  35.83 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  34.63 
 
 
237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 
237 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  34.45 
 
 
243 aa  139  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2054  glycosyl transferase family 2  35.5 
 
 
237 aa  138  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  40.2 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  40.2 
 
 
291 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0997  glycosyl transferase family 2  32.44 
 
 
226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5557  hypothetical protein  37.21 
 
 
176 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 
305 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 
311 aa  118  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  38.19 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  33.97 
 
 
311 aa  116  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  35.75 
 
 
299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  36.32 
 
 
314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  39.71 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2240  glycosyl transferase family 2  34.4 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
450 aa  107  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
353 aa  105  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
340 aa  104  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
321 aa  104  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
229 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.99 
 
 
248 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0752  glycosyl transferase family protein  36.1 
 
 
243 aa  101  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000917436  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
344 aa  101  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0922  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 
284 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 
340 aa  100  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  37.05 
 
 
340 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  34.69 
 
 
355 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 
228 aa  98.6  7e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.22 
 
 
257 aa  98.6  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12000  glycosyl transferase  33.64 
 
 
243 aa  96.3  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.2509  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 
293 aa  94.4  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 
263 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  33.93 
 
 
253 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0757  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
226 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
313 aa  94  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.96 
 
 
264 aa  93.2  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.26 
 
 
305 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 
284 aa  92.4  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1974  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.49 
 
 
250 aa  92  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.696678  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  36.1 
 
 
749 aa  92  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
246 aa  91.7  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  31.49 
 
 
261 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.91 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 
320 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0221  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.51 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.746242  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
229 aa  89.7  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2588  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.89 
 
 
245 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0786175 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2691  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.78 
 
 
262 aa  89.4  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.58271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.51 
 
 
241 aa  89  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 
246 aa  88.6  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1630  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.37 
 
 
253 aa  88.6  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.56 
 
 
247 aa  88.2  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.82 
 
 
239 aa  87.8  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  35.38 
 
 
380 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1971  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
347 aa  88.2  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  38.27 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.03 
 
 
246 aa  87  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
228 aa  87.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14980  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 
239 aa  87  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00134453  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  33.54 
 
 
362 aa  86.7  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1795  glycosyl transferase family 2  35.44 
 
 
357 aa  85.9  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00120607  normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2554  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
385 aa  85.9  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.98 
 
 
809 aa  85.5  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3118  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.04 
 
 
262 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360955  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
448 aa  85.1  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0184  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.64 
 
 
249 aa  85.1  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888944  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  31.14 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.06 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  30.77 
 
 
883 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.46 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0014  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 
357 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00192438  hitchhiker  0.0000617059 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3017  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0914269  hitchhiker  0.00000277643 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0957  glycosyltransferase ycbB  31.36 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00339368  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>