More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8140 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8140  ribonuclease H  100 
 
 		 242 aa  487  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0781  ribonuclease H  44.35 
 
 		 319 aa  106  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07860  RNase HI  44.35 
 
 		 336 aa  105  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0896  Ribonuclease H  38.74 
 
 		 358 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.317285 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1024  ribonuclease H  44.44 
 
 		 154 aa  101  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226266  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2435  Ribonuclease H  33.33 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000684172  hitchhiker  0.00771463 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09420  RNase HI  39.04 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.226214 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1134  ribonuclease H  42.95 
 
 		 150 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326698  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0483  ribonuclease H  41.73 
 
 		 143 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  43.57 
 
 		 147 aa  99.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2112  Ribonuclease H  41.84 
 
 		 141 aa  98.6  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0395213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1199  ribonuclease HI  46.38 
 
 		 145 aa  96.3  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0115399  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1987  ribonuclease H  40.41 
 
 		 159 aa  96.3  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  40.52 
 
 		 154 aa  95.9  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0872  ribonuclease H  40.65 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1464  ribonuclease H  42.96 
 
 		 149 aa  93.2  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0246  ribonuclease H  34.27 
 
 		 149 aa  93.6  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2527  RNase HI  42.14 
 
 		 150 aa  92.8  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08950  Ribonuclease H  40.91 
 
 		 269 aa  92.8  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0897  ribonuclease H  42.45 
 
 		 228 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.681394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0936  ribonuclease H  42.45 
 
 		 228 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  40 
 
 		 161 aa  92  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  40.85 
 
 		 145 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1014  ribonuclease H  42.65 
 
 		 214 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.733459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  40.85 
 
 		 155 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0905  ribonuclease H  39.58 
 
 		 175 aa  91.3  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.690877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  37.06 
 
 		 148 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2573  ribonuclease H  40.85 
 
 		 157 aa  90.5  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0063199  hitchhiker  0.000000590654 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4573  Ribonuclease H  40.97 
 
 		 159 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5812  ribonuclease H  41.01 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  37.06 
 
 		 148 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5247  ribonuclease H  41.73 
 
 		 223 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.021715 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  42.65 
 
 		 153 aa  89.4  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6005  ribonuclease H  41.48 
 
 		 220 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.266469  normal  0.0613425 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  37.76 
 
 		 150 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  39.44 
 
 		 155 aa  88.6  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2570  ribonuclease HI  35.81 
 
 		 160 aa  88.2  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000396954  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  38.3 
 
 		 166 aa  88.2  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29600  ribonuclease H  39.1 
 
 		 152 aa  87.8  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891548  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0263  ribonuclease H  37.58 
 
 		 146 aa  87.8  1e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.988009  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2281  ribonuclease H  37.33 
 
 		 159 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  38.35 
 
 		 148 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  38.35 
 
 		 148 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  36 
 
 		 153 aa  88.2  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  36.69 
 
 		 160 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  42.34 
 
 		 157 aa  87.4  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  37.24 
 
 		 156 aa  87.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  40.29 
 
 		 148 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  36.91 
 
 		 153 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  40.82 
 
 		 156 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  39.1 
 
 		 147 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1992  ribonuclease H  38.89 
 
 		 146 aa  87  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324706 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0761  ribonuclease H  38.16 
 
 		 146 aa  86.3  4e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  42.54 
 
 		 146 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  39.6 
 
 		 156 aa  86.3  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  39.07 
 
 		 150 aa  85.9  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  43.28 
 
 		 148 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  43.28 
 
 		 148 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  43.28 
 
 		 148 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1188  ribonuclease H  39.85 
 
 		 157 aa  86.3  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364672  normal  0.693585 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  43.28 
 
 		 148 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27831  ribonuclease HI  39.74 
 
 		 257 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  43.28 
 
 		 148 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  43.28 
 
 		 148 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1800  ribonuclease H  37.5 
 
 		 183 aa  85.5  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  42.11 
 
 		 154 aa  85.9  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  37.86 
 
 		 153 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  39.86 
 
 		 150 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1763  ribonuclease H  35.66 
 
 		 154 aa  85.5  7e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1879  ribonuclease H  37.5 
 
 		 183 aa  85.5  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0182  ribonuclease H  40.15 
 
 		 157 aa  85.5  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0424  ribonuclease H  35.66 
 
 		 154 aa  85.5  7e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.456208  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  38.3 
 
 		 158 aa  85.1  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  39.13 
 
 		 161 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_002978  WD0304  ribonuclease H  34.9 
 
 		 145 aa  84.7  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0206259  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  36.84 
 
 		 151 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  35.76 
 
 		 155 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  35.76 
 
 		 155 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2151  ribonuclease HI  40.71 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  35.76 
 
 		 155 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2466  RNase HI  40.94 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26323 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  35.76 
 
 		 155 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24830  RNase HI  39.55 
 
 		 170 aa  84.3  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28769 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  39.1 
 
 		 151 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  35.76 
 
 		 155 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  37.86 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3712  ribonuclease HI  39.1 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0350909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1763  ribonuclease H  39.1 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  39.86 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2969  Ribonuclease H  37.41 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113773  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  37.59 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.46 
 
 		 532 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  38.13 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1340  Ribonuclease H  36.67 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  38.13 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  38.13 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0593  ribonuclease H  38.46 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  39.26 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  37.59 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  37.59 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>