More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8136 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 855 aa  1684    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  40.44 
 
 		 861 aa  540  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  40.19 
 
 		 836 aa  510  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  37.64 
 
 		 825 aa  425  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  38.38 
 
 		 841 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  35.72 
 
 		 843 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  38.18 
 
 		 839 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  35.24 
 
 		 842 aa  395  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  36.14 
 
 		 834 aa  382  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  36.59 
 
 		 838 aa  376  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  35.09 
 
 		 848 aa  368  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  34.36 
 
 		 847 aa  365  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  34.21 
 
 		 845 aa  363  9e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  33.72 
 
 		 853 aa  334  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  33.26 
 
 		 856 aa  324  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  32.5 
 
 		 859 aa  320  7.999999999999999e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  37.38 
 
 		 828 aa  320  9e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  33.52 
 
 		 849 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  33.56 
 
 		 849 aa  304  4.0000000000000003e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  30.73 
 
 		 854 aa  296  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  30.52 
 
 		 852 aa  284  6.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  34.18 
 
 		 806 aa  281  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  33.05 
 
 		 871 aa  270  7e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  34.16 
 
 		 846 aa  268  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  32.88 
 
 		 861 aa  268  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  37.02 
 
 		 930 aa  268  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  33.83 
 
 		 857 aa  264  4.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  31.94 
 
 		 853 aa  258  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.4 
 
 		 859 aa  252  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  30.42 
 
 		 873 aa  243  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  32.75 
 
 		 853 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  30.46 
 
 		 821 aa  238  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  30.26 
 
 		 878 aa  234  6e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  35.65 
 
 		 857 aa  211  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  30.53 
 
 		 855 aa  208  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  31.33 
 
 		 866 aa  202  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  30.6 
 
 		 835 aa  197  6e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  26.98 
 
 		 855 aa  161  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  28.03 
 
 		 897 aa  159  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  27.84 
 
 		 880 aa  154  8e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  31.34 
 
 		 846 aa  146  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 822 aa  138  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  28.45 
 
 		 863 aa  133  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.27 
 
 		 857 aa  125  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.11 
 
 		 850 aa  125  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  27.57 
 
 		 807 aa  123  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  21.99 
 
 		 858 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  26.59 
 
 		 849 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  25.39 
 
 		 851 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  19.74 
 
 		 856 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  25.59 
 
 		 854 aa  110  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  27.79 
 
 		 852 aa  106  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  40 
 
 		 873 aa  100  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  27.15 
 
 		 841 aa  98.2  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  25.24 
 
 		 855 aa  95.9  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  28.89 
 
 		 822 aa  94.4  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  23.24 
 
 		 833 aa  94  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  25.62 
 
 		 850 aa  94  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  27.75 
 
 		 874 aa  89.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  21.97 
 
 		 855 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  22.64 
 
 		 858 aa  88.6  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  29.68 
 
 		 801 aa  88.6  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  23.96 
 
 		 858 aa  87.8  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  27.4 
 
 		 828 aa  85.9  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21950  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  49.24 
 
 		 738 aa  85.5  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  29.62 
 
 		 822 aa  84.7  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4065  protein of unknown function DUF214  30.6 
 
 		 488 aa  84.3  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  22.99 
 
 		 849 aa  84.3  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  24.88 
 
 		 855 aa  83.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  25.05 
 
 		 870 aa  82  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  27.08 
 
 		 849 aa  79  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  31.29 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  25.74 
 
 		 857 aa  77.4  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4658  protein of unknown function DUF214  28.41 
 
 		 638 aa  77.4  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  32.88 
 
 		 413 aa  77  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  23.65 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  20.69 
 
 		 896 aa  75.5  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  22.41 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  22.12 
 
 		 386 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  20.06 
 
 		 829 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  20.06 
 
 		 829 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  32.48 
 
 		 775 aa  71.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  23.37 
 
 		 866 aa  71.6  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  24.5 
 
 		 838 aa  70.9  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  29.04 
 
 		 842 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  30.29 
 
 		 452 aa  70.5  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  24.82 
 
 		 436 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0349  protein of unknown function DUF214  23.82 
 
 		 400 aa  70.9  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  22.77 
 
 		 413 aa  69.7  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  29.04 
 
 		 842 aa  69.3  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2729  protein of unknown function DUF214  26.81 
 
 		 796 aa  68.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  32.9 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  23.08 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  22.06 
 
 		 841 aa  67.4  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  23.58 
 
 		 386 aa  67.4  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  30.81 
 
 		 425 aa  66.6  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  28.74 
 
 		 842 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  28.11 
 
 		 401 aa  66.6  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  31.67 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  27.07 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>