124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8127 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8127  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 209 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  32.42 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1887  putative transcriptional regulatory protein  26.36 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.471019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1606  transcriptional regulatory protein, putative  25.45 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00436475  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0208  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 133 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 		 142 aa  53.9  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6084  regulatory protein ArsR  36.99 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1905  putative transcriptional regulator  43.84 
 
 		 176 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7611  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1230  regulatory protein, ArsR  41.1 
 
 		 107 aa  49.3  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  31.76 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  47.27 
 
 		 306 aa  49.3  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5584  transcriptional regulator, TrmB  39.19 
 
 		 307 aa  48.9  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.107073 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  27.47 
 
 		 150 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1887  transcriptional regulator, ArsR family  34.25 
 
 		 184 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4017  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 190 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  40.96 
 
 		 111 aa  48.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 105 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0607  hypothetical protein  36.71 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  43.64 
 
 		 305 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  24.86 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2841  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 110 aa  47  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  41.07 
 
 		 95 aa  47  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 341 aa  46.6  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 328 aa  46.2  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 93 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  43.64 
 
 		 307 aa  46.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1497  transcriptional regulator  30 
 
 		 149 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 84 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0618  regulatory protein, ArsR  34.09 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1532  hypothetical protein  28.89 
 
 		 149 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1651  hypothetical protein  28.89 
 
 		 149 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 317 aa  45.8  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 		 171 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 89 aa  45.8  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  42.62 
 
 		 110 aa  45.8  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1075  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 107 aa  45.4  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000458748  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  39.32 
 
 		 121 aa  45.1  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1386  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 107 aa  45.1  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 117 aa  45.1  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 95 aa  45.1  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 103 aa  45.1  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  39.29 
 
 		 95 aa  45.1  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3009  ArsR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 207 aa  44.7  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 95 aa  45.1  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1739  hypothetical protein  29.55 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0385114  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3024  ArsR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2946  ArsR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.958799  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 122 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0702  hypothetical protein  31.51 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3257  ArsR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4498  transcriptional regulator, ArsR family  40.35 
 
 		 103 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 109 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  26.14 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 115 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 102 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 104 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 121 aa  44.7  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  45.28 
 
 		 333 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 		 95 aa  44.7  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05447  hypothetical protein  47.73 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 131 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  42.59 
 
 		 120 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0996  hypothetical protein  38.98 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1796  hypothetical protein  28.89 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1718  hypothetical protein  28.89 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3255  transcriptional regulator, ArsR family  31.33 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 94 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 118 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2552  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0674571  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0682  transcriptional regulator, ArsR family  44.64 
 
 		 97 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2711  regulatory protein ArsR  42.59 
 
 		 306 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  43.64 
 
 		 322 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 329 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  49.06 
 
 		 120 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  35.59 
 
 		 120 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001509  transcriptional regulator  47.73 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 323 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 119 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1537  ArsR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 149 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 		 105 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  43.64 
 
 		 110 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0746  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  43.64 
 
 		 110 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2099  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 110 aa  42.7  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321507  normal  0.577048 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 111 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 155 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  46.43 
 
 		 341 aa  42.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1101  ArsR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 105 aa  42.7  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00196595  hitchhiker  0.000145009 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 119 aa  42.4  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1931  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 107 aa  42.4  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0246294  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  40 
 
 		 307 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20640  regulatory protein ArsR  30.28 
 
 		 310 aa  42.4  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  43.64 
 
 		 110 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1506  ArsR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 149 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0520742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>