More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8029 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 446 aa  895    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  70.85 
 
 		 468 aa  587  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  66.98 
 
 		 442 aa  573  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  67.14 
 
 		 447 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  65.89 
 
 		 444 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  64.4 
 
 		 437 aa  542  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  65.27 
 
 		 444 aa  538  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  62.65 
 
 		 442 aa  518  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  61.33 
 
 		 446 aa  507  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  60.05 
 
 		 433 aa  495  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  59.15 
 
 		 487 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  56.44 
 
 		 506 aa  482  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  58.85 
 
 		 439 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  56.75 
 
 		 442 aa  414  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  53.01 
 
 		 436 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  50.58 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  53.01 
 
 		 436 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  53.01 
 
 		 436 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  53.67 
 
 		 429 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  53.83 
 
 		 425 aa  385  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5485  hypothetical protein  52.87 
 
 		 448 aa  383  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152012  normal  0.0898392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  44.07 
 
 		 446 aa  335  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  37.61 
 
 		 766 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  35.9 
 
 		 412 aa  262  8e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  40.74 
 
 		 424 aa  257  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  33.1 
 
 		 436 aa  246  6e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  35.13 
 
 		 416 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  35.03 
 
 		 417 aa  243  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.13 
 
 		 416 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  32.88 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  36.14 
 
 		 427 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  35.77 
 
 		 414 aa  205  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  34.65 
 
 		 374 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  35.81 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  33.94 
 
 		 425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  34.1 
 
 		 432 aa  190  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  32.17 
 
 		 430 aa  185  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  35.09 
 
 		 430 aa  183  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  33.57 
 
 		 374 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  33.56 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  34.64 
 
 		 425 aa  180  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  35.01 
 
 		 433 aa  179  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  33.87 
 
 		 429 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  32.65 
 
 		 437 aa  178  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  34.4 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  33.94 
 
 		 429 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  34.58 
 
 		 455 aa  173  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  34.97 
 
 		 425 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  31.56 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  33.48 
 
 		 437 aa  171  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1506  hypothetical protein  31.63 
 
 		 433 aa  169  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  34.47 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  38.03 
 
 		 819 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  34.56 
 
 		 434 aa  167  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  31.83 
 
 		 423 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1667  protein of unknown function DUF323  33.18 
 
 		 374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0550872  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  31.59 
 
 		 425 aa  166  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  32.95 
 
 		 437 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  29.84 
 
 		 383 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  31.03 
 
 		 438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  32.72 
 
 		 412 aa  162  9e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  34.25 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1756  hypothetical protein  30.89 
 
 		 420 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.311507 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  34.28 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  32.95 
 
 		 423 aa  160  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  31.85 
 
 		 409 aa  160  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  31.39 
 
 		 430 aa  159  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  31.43 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  33.63 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  32.03 
 
 		 441 aa  154  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  32.65 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  32.87 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  31.58 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  30.21 
 
 		 418 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  33.24 
 
 		 447 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1407  hypothetical protein  33.65 
 
 		 433 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  33.11 
 
 		 415 aa  150  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2546  protein of unknown function DUF323  33.65 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4271  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  29.53 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1640  hypothetical protein  29.44 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  32.06 
 
 		 470 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  32.88 
 
 		 415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0964  hypothetical protein  32.1 
 
 		 451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2288  hypothetical protein  32.31 
 
 		 411 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3413  protein of unknown function DUF323  31.32 
 
 		 420 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  31.31 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1713  domain of unknown function  31.43 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1759  hypothetical protein  29.3 
 
 		 459 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  32.18 
 
 		 415 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  31.14 
 
 		 430 aa  143  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  30.73 
 
 		 416 aa  143  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0023  hypothetical protein  31.33 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  28.12 
 
 		 398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1050  hypothetical protein  31.22 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3207  hypothetical protein  31.18 
 
 		 407 aa  141  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  32.89 
 
 		 723 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  27.46 
 
 		 412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2253  hypothetical protein  30.8 
 
 		 419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201022  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1598  hypothetical protein  28.29 
 
 		 419 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.785472  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>