More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7962 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7962  aminotransferase class I and II  100 
 
 
365 aa  722    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  69.13 
 
 
363 aa  481  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  67.68 
 
 
370 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  67.04 
 
 
363 aa  455  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  65.47 
 
 
359 aa  451  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  66.57 
 
 
359 aa  449  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  67.22 
 
 
368 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.22 
 
 
379 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11203  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  64.72 
 
 
362 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3866  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06260  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  66.39 
 
 
363 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  62.78 
 
 
376 aa  435  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  66.94 
 
 
433 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0872  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.37 
 
 
618 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4528  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  64.07 
 
 
359 aa  423  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  63.16 
 
 
368 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1139  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  64.61 
 
 
389 aa  411  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4259  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  61.89 
 
 
330 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015166 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4104  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.2 
 
 
330 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4029  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.2 
 
 
330 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1152  succinyldiaminopimelate transaminase  60.34 
 
 
368 aa  397  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240594  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3758  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  63.36 
 
 
368 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2812  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.07 
 
 
382 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4306  aminotransferase class I and II  60.68 
 
 
353 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.643765  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1129  aminotransferase class I and II  60 
 
 
382 aa  393  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1855  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.75 
 
 
328 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.867359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.49 
 
 
379 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26000  aminotransferase  63.1 
 
 
378 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  58.11 
 
 
396 aa  381  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0971  aminotransferase class I and II  60 
 
 
379 aa  380  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5502  aminotransferase class I and II  60.88 
 
 
361 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15500  aminotransferase  56.01 
 
 
383 aa  371  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.694902  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1088  succinyldiaminopimelate transaminase  58.22 
 
 
373 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0994  succinyldiaminopimelate transaminase  62.5 
 
 
382 aa  360  3e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.511076  normal  0.844482 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0802  aminotransferase class I and II  52.22 
 
 
392 aa  352  5e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1193  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  64.18 
 
 
285 aa  346  4e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1685  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.55 
 
 
411 aa  265  5.999999999999999e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  40.06 
 
 
388 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  38.51 
 
 
396 aa  199  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  38.79 
 
 
383 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  38.51 
 
 
396 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  34.12 
 
 
391 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  33.25 
 
 
382 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  32.98 
 
 
403 aa  179  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0659  aminotransferase class I and II  39.77 
 
 
361 aa  177  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  27.49 
 
 
386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  33.68 
 
 
394 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  33.68 
 
 
394 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  32.81 
 
 
400 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  31.43 
 
 
402 aa  170  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1269  aminotransferase class I and II  31.78 
 
 
395 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.58359 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  31.58 
 
 
392 aa  165  9e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  34.96 
 
 
399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.74 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  34.51 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1866  succinyldiaminopimelate transaminase  35.04 
 
 
396 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.37 
 
 
388 aa  162  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.95 
 
 
392 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  31.13 
 
 
393 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  31.93 
 
 
400 aa  162  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  32.19 
 
 
382 aa  159  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.38 
 
 
388 aa  159  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  31.88 
 
 
396 aa  159  8e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  31.75 
 
 
382 aa  158  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1813  succinyldiaminopimelate transaminase  32.91 
 
 
402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1997  succinyldiaminopimelate transaminase  31.74 
 
 
405 aa  156  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  32.73 
 
 
399 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39020  succinyldiaminopimelate transaminase  34.27 
 
 
398 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0524021  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  28.97 
 
 
390 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  30.39 
 
 
388 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  33.08 
 
 
409 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2485  succinyldiaminopimelate transaminase  33.84 
 
 
400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  31.2 
 
 
396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  30.79 
 
 
384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  32.99 
 
 
397 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  31.03 
 
 
411 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.02 
 
 
387 aa  153  5e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  30.77 
 
 
402 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  32.99 
 
 
397 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  29.82 
 
 
411 aa  152  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  31.9 
 
 
407 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2866  aminotransferase  30.69 
 
 
413 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  30.77 
 
 
402 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  30.34 
 
 
399 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  31.4 
 
 
402 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.46 
 
 
388 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  30.69 
 
 
407 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  32.51 
 
 
417 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1758  aminotransferase, class I and II  32.88 
 
 
391 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.39 
 
 
391 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1267  succinyldiaminopimelate transaminase  31.4 
 
 
399 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589506  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2551  aminotransferase, class I and II  32.91 
 
 
400 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138065  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0044  succinyldiaminopimelate transaminase  31.27 
 
 
405 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1331  succinyldiaminopimelate transaminase  31.4 
 
 
399 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  27.25 
 
 
389 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1407  aminotransferase  30.42 
 
 
413 aa  150  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  31.52 
 
 
399 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  31.71 
 
 
400 aa  150  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  30.5 
 
 
412 aa  149  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  29.37 
 
 
390 aa  149  8e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1267  aspartate aminotransferase  28.72 
 
 
404 aa  149  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0259449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>