291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7957 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 
1324 aa  2653    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  42.09 
 
 
1311 aa  924    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  49.81 
 
 
1314 aa  1163    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  39.92 
 
 
1309 aa  885    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  34.85 
 
 
1326 aa  568  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  38.88 
 
 
845 aa  518  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  39.26 
 
 
849 aa  513  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  37.28 
 
 
1500 aa  486  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  37.13 
 
 
838 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  37.91 
 
 
843 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  38.03 
 
 
1383 aa  458  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  34.1 
 
 
1509 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  35.4 
 
 
859 aa  370  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  34.18 
 
 
897 aa  361  4e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  31.57 
 
 
1523 aa  359  2.9999999999999997e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  35.27 
 
 
900 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  33.13 
 
 
1068 aa  349  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  39.77 
 
 
675 aa  347  7e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  34.81 
 
 
992 aa  342  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 
911 aa  338  2.9999999999999997e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  36.96 
 
 
1000 aa  329  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  34.35 
 
 
829 aa  322  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  50.5 
 
 
1046 aa  320  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  33.15 
 
 
934 aa  312  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  31.2 
 
 
899 aa  285  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  31.79 
 
 
963 aa  284  7.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  29.98 
 
 
785 aa  280  1e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  28.3 
 
 
1262 aa  279  3e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
1050 aa  270  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  29.15 
 
 
1010 aa  270  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  25.91 
 
 
1039 aa  270  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  30.57 
 
 
1056 aa  268  5.999999999999999e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  27.75 
 
 
1185 aa  253  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  28.62 
 
 
1261 aa  251  7e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  27.55 
 
 
1125 aa  240  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  25.86 
 
 
1288 aa  234  8.000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  26.75 
 
 
1128 aa  223  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  26.61 
 
 
1131 aa  219  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 
924 aa  219  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 
1105 aa  213  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 
1088 aa  211  9e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  26.18 
 
 
828 aa  196  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.74 
 
 
1424 aa  188  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  29.66 
 
 
713 aa  187  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342423 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  26.84 
 
 
1146 aa  181  9e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  30.45 
 
 
801 aa  178  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 
1283 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  31.15 
 
 
1488 aa  175  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  25.87 
 
 
1136 aa  169  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.13 
 
 
1186 aa  165  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  34.64 
 
 
837 aa  164  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  29.63 
 
 
686 aa  164  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.28 
 
 
767 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 
1215 aa  160  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  21.81 
 
 
1404 aa  159  3e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  38.91 
 
 
373 aa  159  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  33.42 
 
 
385 aa  159  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 
857 aa  154  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  30.94 
 
 
1328 aa  151  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  25.06 
 
 
953 aa  150  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 
454 aa  150  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  23.06 
 
 
1212 aa  150  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 
776 aa  147  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  22.1 
 
 
822 aa  140  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 
814 aa  140  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  26.12 
 
 
1468 aa  137  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  26.1 
 
 
793 aa  136  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6380  hypothetical protein  29.03 
 
 
1017 aa  135  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  28.38 
 
 
457 aa  131  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
843 aa  129  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.85 
 
 
991 aa  127  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  25.75 
 
 
577 aa  127  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  36.82 
 
 
284 aa  121  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  24.81 
 
 
672 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  26.92 
 
 
958 aa  119  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  19.74 
 
 
1550 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 
966 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.29 
 
 
568 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 
568 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
444 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  24.81 
 
 
680 aa  114  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
751 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  27.86 
 
 
825 aa  111  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  28.45 
 
 
1475 aa  111  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  26.3 
 
 
1507 aa  110  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  24.26 
 
 
1228 aa  110  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  31.18 
 
 
919 aa  109  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.68 
 
 
885 aa  106  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  25.99 
 
 
725 aa  106  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  21.96 
 
 
1044 aa  105  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.56 
 
 
841 aa  104  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  27.65 
 
 
1290 aa  101  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.62 
 
 
787 aa  101  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06955  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 
526 aa  99  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.03 
 
 
771 aa  96.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2817  chromosome partitioning ATPase  30.19 
 
 
472 aa  95.9  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3282  chromosome partitioning ATPase  29.91 
 
 
476 aa  95.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  35.8 
 
 
702 aa  94.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 
481 aa  92.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  27.19 
 
 
1106 aa  89  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>