More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7906 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 420 aa  849    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  54.5 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  44.15 
 
 		 416 aa  338  9e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  43.9 
 
 		 416 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  42.55 
 
 		 414 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  37.75 
 
 		 427 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  39.27 
 
 		 425 aa  297  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  34.27 
 
 		 426 aa  270  5e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  38.92 
 
 		 435 aa  266  5.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  33.18 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  32.42 
 
 		 421 aa  206  8e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  30.2 
 
 		 460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  33.25 
 
 		 417 aa  196  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  33.13 
 
 		 419 aa  156  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 		 447 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  29.44 
 
 		 448 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  29.6 
 
 		 420 aa  149  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  31.07 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 		 421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 		 442 aa  146  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 420 aa  146  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  27.69 
 
 		 453 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  28.47 
 
 		 434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  32.03 
 
 		 445 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1773  extracellular solute-binding protein family 1  28.41 
 
 		 465 aa  140  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.504545  normal  0.290135 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  32.43 
 
 		 483 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  29.89 
 
 		 454 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2819  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  32.14 
 
 		 429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  28.91 
 
 		 413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 427 aa  133  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  30.37 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 		 479 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  30.94 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  28.25 
 
 		 441 aa  126  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.79 
 
 		 431 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  29.44 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1639  extracellular solute-binding protein family 1  28.74 
 
 		 463 aa  124  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.102178  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  29.82 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  32.82 
 
 		 442 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12341  periplasmic sugar-binding lipoprotein uspC  26.5 
 
 		 440 aa  119  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 441 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 443 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  28.35 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.03 
 
 		 419 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  28.42 
 
 		 408 aa  113  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  29.29 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01900  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.19 
 
 		 442 aa  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.867357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  29.91 
 
 		 504 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  29.61 
 
 		 503 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.67 
 
 		 426 aa  110  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 410 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  27.64 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  28.38 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  30.98 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28390  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.75 
 
 		 453 aa  106  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  27.52 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  27.55 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  28.35 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.75 
 
 		 464 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 423 aa  104  4e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  27.58 
 
 		 428 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2313  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 901 aa  103  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  28.71 
 
 		 421 aa  103  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3808  extracellular solute-binding protein family 1  33.65 
 
 		 427 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  35.55 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  27.33 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 		 446 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  27.31 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 458 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  28.62 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 431 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 437 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  27.34 
 
 		 411 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  29.3 
 
 		 425 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 		 415 aa  99.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 		 447 aa  99.8  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 		 425 aa  99.8  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2873  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 449 aa  99.4  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.68 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  29.66 
 
 		 426 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  28.95 
 
 		 441 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 446 aa  97.4  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 423 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 450 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 		 457 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.6 
 
 		 411 aa  94.7  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 456 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>