197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7882 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  100 
 
 		 391 aa  770    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  35.08 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  33.33 
 
 		 414 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  35.44 
 
 		 413 aa  107  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  32.58 
 
 		 407 aa  106  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  32.65 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  50.52 
 
 		 494 aa  98.6  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  35.85 
 
 		 485 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  34.84 
 
 		 469 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  32.89 
 
 		 661 aa  89.7  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  31.56 
 
 		 561 aa  86.7  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  30.33 
 
 		 540 aa  86.3  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  44.12 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  29.17 
 
 		 546 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  40.59 
 
 		 572 aa  83.2  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  40.94 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  32.25 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01520  HNH endonuclease  47.78 
 
 		 504 aa  78.2  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  33.75 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  36.3 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  33.95 
 
 		 473 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  36.3 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  33.95 
 
 		 473 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  34.36 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  34.36 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  34.36 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  35.62 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  35.62 
 
 		 473 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  35.62 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  35.62 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  34.93 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  31 
 
 		 505 aa  73.2  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  28.25 
 
 		 567 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  34.93 
 
 		 493 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  34.93 
 
 		 448 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  36.32 
 
 		 255 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  39.22 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  33.58 
 
 		 627 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01940  hypothetical protein  30 
 
 		 524 aa  70.5  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  35.62 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  35.62 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  30.82 
 
 		 531 aa  69.3  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  29.24 
 
 		 458 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  34.07 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  32.76 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  31.06 
 
 		 437 aa  67  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  30 
 
 		 426 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  31.34 
 
 		 518 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  32.91 
 
 		 490 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  30 
 
 		 532 aa  66.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26470  hypothetical protein  30.21 
 
 		 535 aa  64.3  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.231742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4861  HNH endonuclease  38.36 
 
 		 472 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  28.78 
 
 		 526 aa  63.2  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01610  hypothetical protein  31.18 
 
 		 538 aa  63.2  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.746521  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  31.93 
 
 		 552 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  28.69 
 
 		 526 aa  61.6  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  26.89 
 
 		 508 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  30.6 
 
 		 513 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  32.28 
 
 		 620 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  29.24 
 
 		 489 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3452  HNH endonuclease  43.82 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23120  hypothetical protein  27.92 
 
 		 522 aa  61.2  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0151991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18050  hypothetical protein  28.53 
 
 		 577 aa  61.2  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418777  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  37.84 
 
 		 566 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  29.93 
 
 		 499 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  34.17 
 
 		 578 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  33.33 
 
 		 535 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  40.23 
 
 		 497 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  30.69 
 
 		 507 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  40.23 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  29.41 
 
 		 524 aa  59.7  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  31.71 
 
 		 628 aa  59.7  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  30.2 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  33.33 
 
 		 581 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  29.52 
 
 		 556 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  30.4 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  33.33 
 
 		 581 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  37.84 
 
 		 620 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  30.69 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  28.78 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  32.5 
 
 		 507 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  30.69 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  28.78 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  32.5 
 
 		 507 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  32.5 
 
 		 519 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0273  hypothetical protein  34.45 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.88175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2373  hypothetical protein  34.45 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.022356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4558  hypothetical protein  34.45 
 
 		 489 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  30.69 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1846  hypothetical protein  34.45 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  33.33 
 
 		 578 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  40.3 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  32.5 
 
 		 519 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  24.78 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  36.94 
 
 		 568 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  30.95 
 
 		 508 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  31.55 
 
 		 511 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  34.17 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  38.67 
 
 		 551 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  34.45 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>