24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7873 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7873  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  298  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14720  hypothetical protein  50.69 
 
 
153 aa  140  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.100012  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5820  hypothetical protein  47.55 
 
 
150 aa  130  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1451  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.07 
 
 
159 aa  120  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000199447 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2228  hypothetical protein  43.06 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00165353  normal  0.456563 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1449  TPR repeat-containing protein  41.38 
 
 
157 aa  114  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262816  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2375  tetratricopeptide TPR_2  40.44 
 
 
155 aa  107  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0445663 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2173  hypothetical protein  41.18 
 
 
169 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142438  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4012  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 
155 aa  103  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678483  decreased coverage  0.00532252 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3552  hypothetical protein  37.04 
 
 
166 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.497079  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2154  TPR repeat-containing protein  43.75 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.289892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2108  tetratricopeptide TPR_2  43.75 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23340  hypothetical protein  40.85 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863031  normal  0.0195601 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2091  TPR repeat-containing protein  43.75 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.100902 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12785  transmembrane protein  36.03 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.443244 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1220  hypothetical protein  42.98 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1757  hypothetical protein  38.83 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2471  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.91 
 
 
147 aa  77  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.514415  normal  0.576006 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1522  hypothetical protein  36.51 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1028  hypothetical protein  34.43 
 
 
167 aa  73.6  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07130  hypothetical protein  38.78 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183807  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1469  conserved hypothetical secreted protein  39.58 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.22177 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10410  hypothetical protein  32.38 
 
 
133 aa  51.2  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0104588  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0895  hypothetical protein  34.48 
 
 
228 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>