More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7850 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 143 aa  287  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5638  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0524  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1638  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.570464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1665  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5460  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 159 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0641  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1689  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4454  MarR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4541  MarR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.786222  normal  0.801932 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4836  MarR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1731  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2446  regulatory protein MarR  47.5 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  44.58 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  48 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  42.53 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  42.53 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1398  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 312 aa  54.7  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  47.83 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 153 aa  52.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  46.88 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 160 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  32.33 
 
 		 162 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  42.05 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  42.59 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 171 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  34.51 
 
 		 214 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  40.7 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  44.62 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  36.64 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  38.1 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  50 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  30.69 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  52 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  39.13 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  38.67 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  28.74 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  47.37 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  42.68 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5859  MarR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  32.53 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  32.53 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  32.53 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  46.3 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2534  transcriptional regulator, MarR family  34.97 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 157 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 170 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  36.54 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  48.08 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  32.53 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  35.51 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 168 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 165 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  38.98 
 
 		 172 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  43.64 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>