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for query gene Caci_7849 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 485 aa  942    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  64.25 
 
 		 502 aa  518  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  57.14 
 
 		 466 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.88 
 
 		 478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.22 
 
 		 478 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.22 
 
 		 484 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.79 
 
 		 478 aa  438  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.68 
 
 		 478 aa  435  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.37 
 
 		 488 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.94 
 
 		 486 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.94 
 
 		 486 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.94 
 
 		 486 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.83 
 
 		 508 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.94 
 
 		 486 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.94 
 
 		 486 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.94 
 
 		 486 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.03 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5461  major facilitator transporter  43.96 
 
 		 403 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5860  major facilitator transporter  43.96 
 
 		 403 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.36 
 
 		 522 aa  311  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.69 
 
 		 480 aa  303  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.73 
 
 		 534 aa  290  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  39.01 
 
 		 468 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  39.01 
 
 		 468 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.46 
 
 		 458 aa  280  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.62 
 
 		 520 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  38.05 
 
 		 520 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.58 
 
 		 489 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  40 
 
 		 468 aa  260  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 		 452 aa  259  6e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.62 
 
 		 522 aa  259  8e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  37.53 
 
 		 537 aa  256  8e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  41.35 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.06 
 
 		 478 aa  254  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  40.71 
 
 		 457 aa  253  7e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 463 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.38 
 
 		 525 aa  250  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.69 
 
 		 505 aa  250  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.8 
 
 		 522 aa  249  8e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.98 
 
 		 502 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.19 
 
 		 498 aa  246  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.93 
 
 		 503 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 463 aa  246  6.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.82 
 
 		 519 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.38 
 
 		 531 aa  243  6e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.37 
 
 		 524 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.05 
 
 		 489 aa  239  6.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.58 
 
 		 626 aa  239  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.39 
 
 		 520 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 519 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.31 
 
 		 506 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  36.95 
 
 		 503 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.67 
 
 		 521 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.46 
 
 		 530 aa  232  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.472299  hitchhiker  0.00171027 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.07 
 
 		 506 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.07 
 
 		 506 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.14 
 
 		 516 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.47 
 
 		 607 aa  231  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.78 
 
 		 487 aa  231  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 		 528 aa  230  5e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.89 
 
 		 528 aa  229  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.88 
 
 		 515 aa  229  9e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  38.07 
 
 		 507 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5160  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.31 
 
 		 509 aa  226  6e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.21 
 
 		 487 aa  226  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 		 511 aa  226  7e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.53 
 
 		 469 aa  226  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.5 
 
 		 506 aa  226  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2263  major facilitator transporter  39.54 
 
 		 482 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330414  normal  0.0393067 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  36.02 
 
 		 509 aa  224  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3692  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 479 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378275  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.97 
 
 		 510 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4530  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 488 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3833  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 488 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.73 
 
 		 500 aa  224  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  38.33 
 
 		 525 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  38.33 
 
 		 525 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  38.33 
 
 		 525 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  38.66 
 
 		 523 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.1 
 
 		 538 aa  223  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.48 
 
 		 500 aa  223  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.27 
 
 		 492 aa  223  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.21 
 
 		 471 aa  223  9e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 509 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.51 
 
 		 532 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 		 490 aa  222  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 500 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.69 
 
 		 478 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 469 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0971  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.01 
 
 		 475 aa  220  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.79 
 
 		 514 aa  219  6e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
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NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.03 
 
 		 520 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  34.61 
 
 		 530 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
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NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  33.49 
 
 		 534 aa  218  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.17 
 
 		 488 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 		 505 aa  217  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  36.23 
 
 		 516 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
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NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.74 
 
 		 583 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.8 
 
 		 613 aa  216  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.18 
 
 		 534 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
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