More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7832 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 253 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  47.23 
 
 		 245 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 271 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  39.32 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  35.02 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  40 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  28.57 
 
 		 260 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  31.02 
 
 		 342 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  43.8 
 
 		 221 aa  93.2  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 218 aa  92.4  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 224 aa  92  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 236 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 228 aa  88.6  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 272 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 226 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 250 aa  86.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 239 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 249 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 218 aa  85.1  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  32.55 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  34.67 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  29.25 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  28.44 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  28.74 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 234 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  34.35 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  32.59 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  34.06 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 343 aa  68.9  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 223 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  30.04 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  26.42 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  34.35 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  27.75 
 
 		 266 aa  65.1  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  37.9 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  29.96 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  30.37 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  27.93 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6425  putative transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 247 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 283 aa  62  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>