33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7731 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7731  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
129 aa  253  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2916  thioesterase superfamily protein  50.39 
 
 
125 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154067  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1708  thioesterase superfamily protein  54.55 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8316  hypothetical protein  48.74 
 
 
130 aa  100  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3050  hypothetical protein  47.75 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97623  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0086  hypothetical protein  41.44 
 
 
130 aa  93.2  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3033  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3259  thioesterase superfamily protein  52.54 
 
 
131 aa  88.2  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1839  Thioesterase superfamily  39.64 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.696414 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0552  thioesterase superfamily protein  52.21 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000347456  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0128  hypothetical protein  41.74 
 
 
129 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000227024  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2209  thioesterase superfamily protein  42.73 
 
 
132 aa  84  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000185786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3066  thioesterase superfamily protein  42.73 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.22535e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2252  thioesterase superfamily protein  38.66 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3802  hypothetical protein  43.56 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474484  hitchhiker  0.000140852 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1847  thioesterase superfamily protein  44.92 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3560  hypothetical protein  42.45 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3182  hypothetical protein  43.02 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231054  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0080  hypothetical protein  36.67 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0696  dihydrolipoamide acyltransferase  40.57 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5923  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.036781  normal  0.299905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1742  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3982  hypothetical protein  32.63 
 
 
137 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1520  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
133 aa  50.4  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3233  hypothetical protein  35.79 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2467  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0155  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1187  hypothetical protein  30.53 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.238156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1367  hypothetical protein  31.58 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.412504  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1291  hypothetical protein  26.89 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0813  hypothetical protein  25.42 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.823237  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3983  thioesterase superfamily protein  34.85 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000686443 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>