More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7676 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 269 aa  534  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  50.59 
 
 		 258 aa  242  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  51.76 
 
 		 258 aa  241  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  33.86 
 
 		 268 aa  122  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 		 275 aa  121  9e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  29.62 
 
 		 275 aa  118  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  32.12 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  30.85 
 
 		 266 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  31.92 
 
 		 284 aa  99.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  32.43 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1114  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 		 286 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0902731  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 265 aa  95.5  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 		 264 aa  95.5  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.84 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 		 277 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  27.7 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0509  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 275 aa  90.1  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.391002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 279 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 302 aa  88.2  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  28.96 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  29.41 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  30.28 
 
 		 425 aa  87  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 		 277 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7352  Alpha/beta hydrolase  29.74 
 
 		 291 aa  85.5  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  31.76 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  27.84 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  25.19 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 		 425 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.04 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  29.5 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  25.99 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.34 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  28.21 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1703  alpha/beta hydrolase fold  27.98 
 
 		 502 aa  79.3  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  26.88 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  24.82 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  29.85 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  30.8 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  25.45 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.65 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  28.63 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  31.45 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.57 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  24.37 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  24.35 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  29.74 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  23.95 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  40.62 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  30.4 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  29.54 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  30.4 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 298 aa  75.5  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  27.45 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3020  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5346  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00669533  normal  0.437988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4494  alpha/beta family hydrolase  26.74 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  24.35 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  28.52 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  26.88 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>