More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7619 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 379 aa  768    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  46.15 
 
 		 506 aa  271  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  44.3 
 
 		 481 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  44.25 
 
 		 468 aa  245  8e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.95 
 
 		 468 aa  243  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  47.43 
 
 		 618 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1166  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  43.11 
 
 		 395 aa  234  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2383  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.52 
 
 		 389 aa  229  6e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0868762  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1965  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.39 
 
 		 487 aa  225  9e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000312518 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.82 
 
 		 400 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08570  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  39.29 
 
 		 365 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.671315  normal  0.595892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7541  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.64 
 
 		 540 aa  222  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1167  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  39.52 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30000  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  42.16 
 
 		 395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3302  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.92 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.45 
 
 		 478 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7618  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.21 
 
 		 643 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2228  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.98 
 
 		 521 aa  210  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000756142  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.13 
 
 		 584 aa  209  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.56 
 
 		 480 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  37.32 
 
 		 530 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0624  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.93 
 
 		 481 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2594  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.96 
 
 		 442 aa  202  8e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.49 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0126  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.44 
 
 		 499 aa  199  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08580  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  37.14 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.393457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.79 
 
 		 549 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3214  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.97 
 
 		 443 aa  190  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235319 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3844  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  34.13 
 
 		 373 aa  189  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.56 
 
 		 520 aa  185  9e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.66 
 
 		 512 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.39 
 
 		 486 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.44 
 
 		 390 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37600  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.95 
 
 		 619 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1864  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.91 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.383316  normal  0.036217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.75 
 
 		 497 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1025  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.81 
 
 		 434 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11457  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.02 
 
 		 509 aa  163  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0589  putative transcriptional regulator  30.26 
 
 		 498 aa  158  1e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.581304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.57 
 
 		 516 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.45 
 
 		 491 aa  156  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.1 
 
 		 504 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.91 
 
 		 545 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4976  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.5 
 
 		 551 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.03 
 
 		 520 aa  153  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0935  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.38 
 
 		 465 aa  152  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0761113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  32.11 
 
 		 505 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.97 
 
 		 573 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.92 
 
 		 625 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  29.3 
 
 		 734 aa  146  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4529  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.77 
 
 		 365 aa  145  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.87 
 
 		 393 aa  142  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.67 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  30.77 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.46 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5205  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.54 
 
 		 560 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0714783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1666  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.25 
 
 		 649 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5087  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.27 
 
 		 687 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.67 
 
 		 307 aa  136  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  33.23 
 
 		 349 aa  135  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1037  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.12 
 
 		 732 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28900  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  29.81 
 
 		 522 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.385343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 336 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00540  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.14 
 
 		 357 aa  133  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.916603  normal  0.105126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4513  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.99 
 
 		 699 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4600  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.99 
 
 		 699 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4896  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.99 
 
 		 701 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10837  hypothetical protein  29.11 
 
 		 684 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372154 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20880  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  37.12 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08920  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.55 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1026  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.46 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.999724  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.82 
 
 		 409 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.56 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.36 
 
 		 311 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.36 
 
 		 311 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.36 
 
 		 311 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.38 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0711  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.28 
 
 		 526 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.74 
 
 		 407 aa  126  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6814  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.02 
 
 		 1336 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6349  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.36 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.2 
 
 		 521 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5665  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.1 
 
 		 306 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.0393509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3228  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.23 
 
 		 377 aa  122  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0471557  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  37.56 
 
 		 434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2384  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.33 
 
 		 303 aa  119  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174416  hitchhiker  0.00797054 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4212  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.94 
 
 		 496 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.134321 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6348  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.11 
 
 		 517 aa  119  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352796  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08470  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.96 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.282031 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08810  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.86 
 
 		 374 aa  119  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.155806  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1165  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  39.44 
 
 		 363 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5903  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.3 
 
 		 508 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.667474 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3034  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.11 
 
 		 379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.63975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6386  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.12 
 
 		 382 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4615  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.12 
 
 		 510 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0762  transcriptional regulator  30.04 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  33.59 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2567  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.18 
 
 		 404 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8771  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.2 
 
 		 547 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.64 
 
 		 563 aa  113  6e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>