More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7616 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  100 
 
 
364 aa  717    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  62.88 
 
 
364 aa  421  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  61.77 
 
 
359 aa  419  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  61.6 
 
 
357 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6337  Nucleotidyl transferase  62.05 
 
 
359 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  60.22 
 
 
364 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  60.22 
 
 
357 aa  385  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  57.89 
 
 
363 aa  383  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  56.51 
 
 
365 aa  381  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  56.91 
 
 
359 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  59.94 
 
 
351 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  55.96 
 
 
370 aa  368  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  55.8 
 
 
359 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  55.8 
 
 
359 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  56.16 
 
 
359 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  55.8 
 
 
359 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  55.77 
 
 
359 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0451  nucleotidyl transferase  57.6 
 
 
336 aa  341  1e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.68714  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  38.51 
 
 
349 aa  238  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  35.29 
 
 
370 aa  236  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  37.43 
 
 
370 aa  236  6e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  42.47 
 
 
366 aa  232  6e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  34.76 
 
 
370 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  37.9 
 
 
361 aa  224  2e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  37.03 
 
 
361 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  35.16 
 
 
361 aa  217  2e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  36.83 
 
 
827 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  37.2 
 
 
367 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.39 
 
 
828 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  35.08 
 
 
834 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  38.79 
 
 
347 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  34.73 
 
 
832 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  38.1 
 
 
843 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  34.38 
 
 
348 aa  206  7e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  36.95 
 
 
347 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  34.25 
 
 
821 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  30.96 
 
 
835 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  33.43 
 
 
833 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  31.58 
 
 
842 aa  202  6e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  32.04 
 
 
840 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  38.16 
 
 
828 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  35.39 
 
 
841 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  32.05 
 
 
830 aa  200  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  32.27 
 
 
828 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  31.49 
 
 
842 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  29.22 
 
 
816 aa  199  5e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  34.62 
 
 
854 aa  199  6e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  29.92 
 
 
843 aa  199  6e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  33.15 
 
 
832 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  32.88 
 
 
832 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  31.23 
 
 
835 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.49 
 
 
842 aa  196  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  31.34 
 
 
842 aa  193  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  30.11 
 
 
841 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  29.92 
 
 
827 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  32.32 
 
 
837 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  29.79 
 
 
830 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  31.9 
 
 
833 aa  186  8e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  29.28 
 
 
818 aa  186  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0738  Nucleotidyl transferase  38.1 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0293389  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  32.04 
 
 
818 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  30.05 
 
 
820 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  30.41 
 
 
820 aa  184  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  30.14 
 
 
835 aa  182  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  28.73 
 
 
836 aa  182  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  29.49 
 
 
784 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  29.49 
 
 
784 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  28.3 
 
 
810 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  28.18 
 
 
835 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.38 
 
 
836 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  28.95 
 
 
784 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.95 
 
 
784 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  28.95 
 
 
784 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  28.95 
 
 
784 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.46 
 
 
836 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  28.46 
 
 
836 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.69 
 
 
784 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  28.42 
 
 
828 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  27.82 
 
 
784 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  31.98 
 
 
362 aa  171  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  28.42 
 
 
712 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  28.27 
 
 
784 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  28.27 
 
 
784 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  28.53 
 
 
392 aa  170  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  29.13 
 
 
392 aa  168  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  33.94 
 
 
326 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  27.22 
 
 
785 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  26.34 
 
 
776 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  28.61 
 
 
387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  34.04 
 
 
346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  27.25 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  26.63 
 
 
399 aa  160  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  30.61 
 
 
343 aa  160  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  28.07 
 
 
387 aa  158  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  26.74 
 
 
387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  32.65 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0827  nucleotidyl transferase  30.59 
 
 
388 aa  146  5e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  27.97 
 
 
364 aa  145  8.000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03020  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  29.49 
 
 
364 aa  145  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1890  nucleotidyl transferase  29.89 
 
 
357 aa  145  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.661089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>