More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7614 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
157 aa  309  9e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  51.06 
 
 
144 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  51.77 
 
 
158 aa  125  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  45.26 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  45 
 
 
152 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  44.2 
 
 
149 aa  100  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  40.29 
 
 
159 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  43.94 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4592  transcriptional regulator, MarR family  43.07 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0409464  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  41.84 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  41 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  39 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  41 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  36.42 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
155 aa  67  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
244 aa  65.1  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  32.62 
 
 
169 aa  63.9  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  32.12 
 
 
140 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  34.17 
 
 
287 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
180 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 
158 aa  61.2  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
158 aa  61.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
172 aa  61.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
153 aa  60.5  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  31.58 
 
 
168 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
140 aa  58.9  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 
169 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
176 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 
186 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 
146 aa  58.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
174 aa  58.2  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
174 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  35 
 
 
145 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0353  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases-like protein  34.65 
 
 
168 aa  58.2  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 
176 aa  57.8  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  30.3 
 
 
168 aa  57.4  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
178 aa  57.4  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  25.78 
 
 
142 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
184 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
188 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
194 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  29.46 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 
189 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 
161 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
171 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  42 
 
 
157 aa  54.7  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 
177 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  27.21 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
303 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
161 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
161 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
161 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
159 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
169 aa  54.3  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 
161 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
157 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
161 aa  53.9  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
151 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 
161 aa  53.9  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
151 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
151 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  33 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 
193 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  37.61 
 
 
292 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
190 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>