More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7594 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7594  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 228 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0426147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  83.56 
 
 		 225 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  82.51 
 
 		 225 aa  368  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  80.36 
 
 		 225 aa  363  1e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1765  two component transcriptional regulator  83.11 
 
 		 225 aa  355  2.9999999999999997e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.85 
 
 		 261 aa  354  5e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1412  response regulator receiver protein  83.56 
 
 		 225 aa  353  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  0.0125199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3745  two component transcriptional regulator, winged helix family  81.33 
 
 		 225 aa  352  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.5489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.48 
 
 		 227 aa  349  2e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0770  winged helix family two component transcriptional regulator  82.67 
 
 		 225 aa  349  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.10066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2514  two component transcriptional regulator, winged helix family  77.13 
 
 		 226 aa  344  7e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.24701  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  76.92 
 
 		 223 aa  344  7e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1433  response regulator receiver  80.18 
 
 		 248 aa  342  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2332  two component transcriptional regulator, winged helix family  80.89 
 
 		 227 aa  339  2e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0100882  decreased coverage  0.00000063533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  77.13 
 
 		 224 aa  339  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.78 
 
 		 224 aa  338  4e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  75.33 
 
 		 229 aa  337  9e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  75.33 
 
 		 229 aa  336  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30940  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  79.46 
 
 		 225 aa  336  1.9999999999999998e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.2 
 
 		 238 aa  323  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  70.4 
 
 		 231 aa  320  9.000000000000001e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  71.04 
 
 		 239 aa  319  1.9999999999999998e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4249  two component transcriptional regulator, winged helix family  76 
 
 		 225 aa  317  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.316157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1347  two component transcriptional regulator  73.57 
 
 		 228 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1365  two component transcriptional regulator  73.57 
 
 		 228 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1381  two component transcriptional regulator  73.57 
 
 		 228 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.3 
 
 		 227 aa  316  2e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3637  response regulator receiver  75.45 
 
 		 225 aa  315  3e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13275  two component system sensor transduction transcriptional regulatory protein mtrA  72.69 
 
 		 228 aa  315  4e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.656178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1752  two component transcriptional regulator  72.69 
 
 		 228 aa  314  7e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4712  two component transcriptional regulator  72.69 
 
 		 228 aa  314  7e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541483  normal  0.0134498 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  73.42 
 
 		 226 aa  313  9.999999999999999e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1849  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.24 
 
 		 229 aa  307  6.999999999999999e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1076  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.49 
 
 		 228 aa  306  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  55.6 
 
 		 240 aa  246  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  53.64 
 
 		 228 aa  223  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  50.67 
 
 		 230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.89 
 
 		 242 aa  218  3.9999999999999997e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  49.78 
 
 		 256 aa  218  5e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  52.25 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2168  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  47.16 
 
 		 239 aa  214  7e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  47.16 
 
 		 239 aa  214  7e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 235 aa  211  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  48.67 
 
 		 235 aa  210  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 235 aa  210  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  48.67 
 
 		 235 aa  210  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  48.67 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  48.67 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  48.67 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  48.67 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  48.67 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  48.67 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  48.67 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  50.67 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  51.11 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.44 
 
 		 233 aa  208  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  51.13 
 
 		 229 aa  208  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 239 aa  207  8e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 233 aa  207  8e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 226 aa  207  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.68 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  52.7 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  52.7 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  52.7 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  47.14 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  47.14 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  49.55 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.54 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 229 aa  205  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.04 
 
 		 226 aa  205  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  51.36 
 
 		 225 aa  204  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  50.9 
 
 		 228 aa  205  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.68 
 
 		 237 aa  204  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 236 aa  204  9e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  48.28 
 
 		 235 aa  204  9e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  51.13 
 
 		 227 aa  202  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 		 235 aa  202  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  47.77 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.27 
 
 		 223 aa  202  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 242 aa  202  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  46.98 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  48.71 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  49.34 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0260  response regulator receiver protein  49.1 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  50.9 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 230 aa  201  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>