More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7593 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  100 
 
 
608 aa  1219  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.95 
 
 
575 aa  474  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1434  ATPase domain-containing protein  48.67 
 
 
544 aa  461  1e-128  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.28 
 
 
539 aa  459  1e-128  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.16 
 
 
581 aa  458  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4042  histidine kinase  50.92 
 
 
594 aa  451  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554212  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0771  histidine kinase  48.45 
 
 
594 aa  446  1e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2495  sensor histidine kinase  49.72 
 
 
579 aa  442  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.89 
 
 
605 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404155  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0968  ATPase domain-containing protein  46.74 
 
 
557 aa  416  1e-115  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0905  histidine kinase  46.65 
 
 
557 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474957  normal  0.117481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  42.81 
 
 
597 aa  411  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1850  histidine kinase  45.01 
 
 
554 aa  406  1e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.61 
 
 
601 aa  408  1e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1753  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 
547 aa  406  1e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408385  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.83 
 
 
555 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.801088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.83 
 
 
555 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.48 
 
 
551 aa  399  1e-110  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848915 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
574 aa  400  1e-110  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  45.89 
 
 
586 aa  400  1e-110  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1413  Signal transduction histidine kinase-like protein  48.82 
 
 
579 aa  400  1e-110  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119595  normal  0.0381206 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30930  signal transduction histidine kinase  45.32 
 
 
577 aa  396  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1241  histidine kinase  49.15 
 
 
587 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560474  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6309  histidine kinase  47.08 
 
 
801 aa  399  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3636  ATP-binding region ATPase domain protein  43.67 
 
 
557 aa  398  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351374  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.01 
 
 
552 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13274  two component system sensor transduction histidine kinase mtrB  44.61 
 
 
567 aa  397  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.620022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2331  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.24 
 
 
589 aa  392  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000623788  decreased coverage  1.24143e-06 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  57.31 
 
 
558 aa  380  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 
554 aa  346  7e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.696871  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  47.27 
 
 
607 aa  343  4e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4248  histidine kinase  40.36 
 
 
648 aa  334  3e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.24223  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20640  signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 
572 aa  323  7e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0698794  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08600  signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 
538 aa  310  4e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.890839  normal  0.98586 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0043  signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
565 aa  285  2e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0980006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  38 
 
 
505 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.01 
 
 
460 aa  183  8e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  37.98 
 
 
450 aa  174  6e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
487 aa  174  6e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  8.76727e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.58 
 
 
468 aa  174  6e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2765  histidine kinase  37.39 
 
 
450 aa  161  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13580  signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 
613 aa  160  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.111156 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
471 aa  157  5e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 
452 aa  157  5e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  34.77 
 
 
482 aa  156  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
471 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 
467 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.113829  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
364 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  33.56 
 
 
364 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  33.56 
 
 
364 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  30.73 
 
 
463 aa  150  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 
462 aa  150  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  28.92 
 
 
518 aa  150  9e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
493 aa  147  4e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
473 aa  147  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  29.7 
 
 
466 aa  144  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  29.7 
 
 
466 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  29.7 
 
 
466 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 
504 aa  144  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  5.12156e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  29.7 
 
 
466 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
425 aa  144  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  31.91 
 
 
496 aa  144  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  3.09277e-05  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  36.27 
 
 
594 aa  143  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.44 
 
 
486 aa  144  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 
466 aa  142  1e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.1534e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  31.12 
 
 
501 aa  142  1e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  29.39 
 
 
466 aa  143  1e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
496 aa  142  2e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.93 
 
 
1038 aa  142  2e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 
1145 aa  142  2e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  27.88 
 
 
463 aa  142  2e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  29.09 
 
 
466 aa  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  28.27 
 
 
1119 aa  141  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 
640 aa  141  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2142  histidine kinase  36.91 
 
 
502 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000590991  normal  0.0793761 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  28.83 
 
 
456 aa  141  4e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
457 aa  140  5e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
483 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  29.09 
 
 
466 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
639 aa  140  7e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  29.97 
 
 
508 aa  140  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 
723 aa  140  8e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
546 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  30.59 
 
 
482 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  28.05 
 
 
463 aa  139  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
500 aa  139  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
359 aa  139  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  32.58 
 
 
356 aa  139  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 
437 aa  139  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 
513 aa  138  3e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.0063e-06  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
503 aa  138  3e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 
1853 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
464 aa  137  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 
438 aa  138  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 
389 aa  137  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2709  histidine kinase  33.44 
 
 
855 aa  137  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
459 aa  137  6e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
379 aa  137  6e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
379 aa  137  6e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4931  sensory box histidine kinase  25.55 
 
 
617 aa  137  6e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>