125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7583 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7583  protein of unknown function DUF470  100 
 
 		 597 aa  1183    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.389483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0206  hypothetical protein  37.8 
 
 		 599 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.914985  normal  0.140787 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11635  hypothetical protein  40.24 
 
 		 484 aa  213  7e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 		 1132 aa  210  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 1094 aa  206  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 		 1118 aa  200  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 		 1113 aa  197  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  31.08 
 
 		 592 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1547  hypothetical protein  35.39 
 
 		 656 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.736781  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2745  hypothetical protein  31.86 
 
 		 643 aa  194  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 1138 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2476  protein of unknown function DUF470  34.38 
 
 		 578 aa  183  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 1100 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 		 1172 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 		 1101 aa  180  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  33.71 
 
 		 1098 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 1112 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 1112 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 		 1111 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 1120 aa  174  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1219  hypothetical protein  31.27 
 
 		 917 aa  169  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316039  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  33.43 
 
 		 1147 aa  167  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 		 1100 aa  166  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8424  protein of unknown function DUF470  34.09 
 
 		 701 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0378  protein of unknown function DUF470  32.95 
 
 		 938 aa  152  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173445  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  23.08 
 
 		 556 aa  131  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  25.71 
 
 		 556 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  25.71 
 
 		 556 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3394  protein of unknown function DUF470  31.15 
 
 		 850 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  28.51 
 
 		 568 aa  123  9e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.11 
 
 		 859 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.11 
 
 		 859 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  23.81 
 
 		 861 aa  108  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  23.81 
 
 		 861 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  23.81 
 
 		 861 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  23.81 
 
 		 861 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  23.81 
 
 		 861 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  23.81 
 
 		 861 aa  107  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  27.06 
 
 		 863 aa  107  8e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  23.81 
 
 		 861 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  23.51 
 
 		 861 aa  106  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  23.41 
 
 		 862 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  26.45 
 
 		 863 aa  103  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  26.73 
 
 		 839 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  25.61 
 
 		 854 aa  101  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  23.21 
 
 		 858 aa  97.4  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1364  hypothetical protein  26.52 
 
 		 857 aa  96.7  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2334  protein of unknown function DUF470  26.23 
 
 		 844 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  24.04 
 
 		 847 aa  95.1  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  25.23 
 
 		 723 aa  95.5  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  28.86 
 
 		 872 aa  92.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  21.36 
 
 		 851 aa  91.7  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  21.36 
 
 		 851 aa  91.7  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2601  hypothetical protein  28.51 
 
 		 877 aa  91.3  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00218331  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  27.41 
 
 		 880 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1037  hypothetical protein  22.49 
 
 		 852 aa  90.9  6e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  23.69 
 
 		 861 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  28.31 
 
 		 850 aa  88.2  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  26.51 
 
 		 854 aa  87.8  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  26.53 
 
 		 871 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  26.45 
 
 		 871 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  20 
 
 		 840 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  29.03 
 
 		 864 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  21.47 
 
 		 861 aa  85.5  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  25.8 
 
 		 877 aa  84.3  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  28 
 
 		 896 aa  84  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  26.15 
 
 		 880 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  26.15 
 
 		 880 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  22.96 
 
 		 395 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  23.25 
 
 		 569 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  25.94 
 
 		 880 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  22.89 
 
 		 844 aa  82.4  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  25.94 
 
 		 880 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  25.89 
 
 		 879 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  19.88 
 
 		 875 aa  81.3  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  28.45 
 
 		 844 aa  80.9  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  23.77 
 
 		 881 aa  80.5  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  20.62 
 
 		 851 aa  80.5  0.00000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  27.56 
 
 		 346 aa  80.1  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  28.15 
 
 		 844 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  25.85 
 
 		 880 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  24.36 
 
 		 870 aa  78.2  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  24.35 
 
 		 850 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  24.03 
 
 		 850 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  24.77 
 
 		 869 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  24.03 
 
 		 850 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  24.16 
 
 		 850 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  23.62 
 
 		 850 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  23.69 
 
 		 850 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  23.38 
 
 		 850 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  20.92 
 
 		 813 aa  73.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  26.07 
 
 		 875 aa  73.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  24.76 
 
 		 881 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  21.6 
 
 		 590 aa  72.4  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  18.79 
 
 		 840 aa  72  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  18.79 
 
 		 840 aa  72  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  25.08 
 
 		 881 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4377  hypothetical protein  21.91 
 
 		 905 aa  70.9  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.947401  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  25 
 
 		 867 aa  70.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3572  protein of unknown function DUF470  24.92 
 
 		 346 aa  70.1  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>