25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7574 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7574  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  100 
 
 
385 aa  722    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2399  leucine rich repeat protein  58.33 
 
 
368 aa  345  6e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1436  hypothetical protein  26.28 
 
 
815 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0147013 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0112  cyclin domain-containing protein  28.18 
 
 
770 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0526  hypothetical protein  28.39 
 
 
372 aa  72  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34199  predicted protein  31.44 
 
 
471 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42557  predicted protein  28.44 
 
 
692 aa  64.7  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34148  predicted protein  29.31 
 
 
466 aa  65.1  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0271154  normal  0.859268 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1579  hypothetical protein  26.51 
 
 
464 aa  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1120  hypothetical protein  25.23 
 
 
781 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1227  hypothetical protein  25.77 
 
 
430 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643545 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0729  hypothetical protein  26.46 
 
 
476 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39238  predicted protein  23.89 
 
 
591 aa  57.4  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.975604  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0110  hypothetical protein  30.94 
 
 
254 aa  57  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  28.67 
 
 
620 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40174  predicted protein  30.77 
 
 
897 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4051  hypothetical protein  26.3 
 
 
400 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1477  hypothetical protein  23.87 
 
 
614 aa  50.1  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34431  predicted protein  28.74 
 
 
261 aa  49.7  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.362654  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1383  hypothetical protein  22.87 
 
 
465 aa  48.9  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1940  hypothetical protein  25 
 
 
534 aa  46.6  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0025  cyclin domain-containing protein  24.73 
 
 
807 aa  46.2  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01777  GALA protein  30.28 
 
 
981 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254341  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2330  hypothetical protein  30.06 
 
 
304 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5718  predicted protein  29.07 
 
 
241 aa  43.9  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0287737  decreased coverage  0.00877055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>