More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7556 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  100 
 
 		 295 aa  595  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  66.43 
 
 		 282 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  68.75 
 
 		 282 aa  348  4e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  66.8 
 
 		 270 aa  341  7e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  63.71 
 
 		 263 aa  340  2e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  63.94 
 
 		 360 aa  333  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  63.94 
 
 		 312 aa  330  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  63.3 
 
 		 310 aa  330  2e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  66.54 
 
 		 276 aa  326  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  63.85 
 
 		 277 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  61.22 
 
 		 285 aa  324  1e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  66.15 
 
 		 276 aa  323  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2737  glutamate racemase  64.29 
 
 		 292 aa  319  3.9999999999999996e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  63.18 
 
 		 270 aa  318  7.999999999999999e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  61.28 
 
 		 268 aa  318  9e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0872  glutamate racemase  61.21 
 
 		 300 aa  317  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1323  glutamate racemase  65.77 
 
 		 285 aa  317  2e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.123332  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  60.7 
 
 		 301 aa  315  8e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  61.87 
 
 		 264 aa  313  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  60.47 
 
 		 271 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  60.77 
 
 		 293 aa  308  6.999999999999999e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25070  glutamate racemase  63.46 
 
 		 268 aa  308  8e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  57.74 
 
 		 277 aa  301  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  61.75 
 
 		 265 aa  294  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2356  glutamate racemase  59 
 
 		 278 aa  291  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0885  glutamate racemase  59.7 
 
 		 268 aa  290  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  57.52 
 
 		 280 aa  288  9e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  57.52 
 
 		 280 aa  288  9e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3832  glutamate racemase  57.14 
 
 		 280 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4289  glutamate racemase  57.36 
 
 		 281 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1969  glutamate racemase  54.58 
 
 		 254 aa  263  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  47.74 
 
 		 272 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  43.68 
 
 		 264 aa  225  8e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  45.21 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  46.24 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  44.32 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  43.08 
 
 		 269 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  43.08 
 
 		 269 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  43.3 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  42.59 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  42.59 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  42.59 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  44.07 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  42.59 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  42.91 
 
 		 269 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  42.91 
 
 		 269 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  42.21 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  44.69 
 
 		 275 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  41.2 
 
 		 303 aa  208  7e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  43.23 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  43.3 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  44.85 
 
 		 281 aa  203  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  41.54 
 
 		 271 aa  203  3e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  41.41 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  41.15 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  42.47 
 
 		 265 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  41.18 
 
 		 264 aa  200  3e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  41.01 
 
 		 307 aa  199  6e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  41.04 
 
 		 280 aa  199  6e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  41.04 
 
 		 280 aa  198  7e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  45.08 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  43.3 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  40.74 
 
 		 276 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  39.76 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  46.22 
 
 		 281 aa  192  6e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  36.64 
 
 		 267 aa  192  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  39.38 
 
 		 270 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1752  glutamate racemase  42.86 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  41.54 
 
 		 275 aa  186  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  41.54 
 
 		 275 aa  186  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  43.02 
 
 		 276 aa  186  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  41.57 
 
 		 289 aa  185  8e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  39.23 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  39.03 
 
 		 295 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  37.75 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  38.04 
 
 		 292 aa  178  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1865  glutamate racemase  39.01 
 
 		 283 aa  178  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0131897  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  39.53 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0806  glutamate racemase  38.13 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0847  glutamate racemase  38.13 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0942  glutamate racemase  38.13 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000979949 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  39.15 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1031  glutamate racemase  38.13 
 
 		 275 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00684957  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  39.85 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0755  glutamate racemase  38.13 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  39.31 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  41.67 
 
 		 272 aa  176  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  37.55 
 
 		 295 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  43.68 
 
 		 268 aa  176  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  41.29 
 
 		 282 aa  175  7e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  39.45 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0939  glutamate racemase  37.35 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  41.41 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  39.55 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  39.37 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  39.37 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  38.91 
 
 		 261 aa  172  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  38.52 
 
 		 281 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  41.67 
 
 		 285 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  40.53 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>