33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7529 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7529  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 457 aa  888    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  41.63 
 
 		 431 aa  293  4e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.92 
 
 		 418 aa  278  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0980  transcriptional regulator, XRE family  36.78 
 
 		 445 aa  190  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6698  transcriptional regulator, XRE family  36.18 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  27.91 
 
 		 503 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0510  helix-turn-helix domain-containing protein  27.88 
 
 		 473 aa  83.6  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  29.45 
 
 		 484 aa  64.7  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  29.26 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  28.95 
 
 		 503 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  28.51 
 
 		 537 aa  60.1  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  26.22 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0917  hypothetical protein  26.41 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5500  helix-turn-helix domain protein  38.02 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000165306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7489  hypothetical protein  34.27 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0882714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  28.49 
 
 		 519 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4607  hypothetical protein  30.95 
 
 		 369 aa  54.3  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 277 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  23.72 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  26.48 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  28.95 
 
 		 449 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  24.55 
 
 		 434 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  24.51 
 
 		 477 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  27.91 
 
 		 519 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1056  helix-turn-helix domain-containing protein  47.06 
 
 		 135 aa  47.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  31.62 
 
 		 556 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1019  hypothetical protein  26.25 
 
 		 288 aa  47  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4677  transcriptional regulator, XRE family  31.63 
 
 		 120 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0250  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 335 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4608  hypothetical protein  24.86 
 
 		 363 aa  43.9  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4118  formylmethionine deformylase  39.66 
 
 		 506 aa  43.1  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>