More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7524 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7524  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
503 aa  964  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47136  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  48.13 
 
 
498 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4079  major facilitator transporter  48.46 
 
 
470 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0276069  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3373  major facilitator superfamily MFS_1  45.38 
 
 
482 aa  338  1e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.9 
 
 
763 aa  253  4e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  38.07 
 
 
494 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.13 
 
 
487 aa  236  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.47 
 
 
534 aa  235  2e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.34 
 
 
487 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.74 
 
 
498 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  36.51 
 
 
489 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.99 
 
 
487 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.75 
 
 
490 aa  226  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.05 
 
 
1112 aa  219  7e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.16 
 
 
474 aa  219  8e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.33 
 
 
519 aa  217  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.96 
 
 
508 aa  216  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37 
 
 
527 aa  216  9e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.38 
 
 
478 aa  215  1e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  6.83759e-05 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  36.39 
 
 
497 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.46 
 
 
788 aa  206  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.12 
 
 
519 aa  206  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.08 
 
 
489 aa  206  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 
491 aa  203  5e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  36.9 
 
 
492 aa  202  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.32 
 
 
487 aa  200  4e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4704  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 
478 aa  200  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  36.83 
 
 
490 aa  199  8e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  35.96 
 
 
489 aa  199  1e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.73 
 
 
493 aa  198  2e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  35.89 
 
 
483 aa  198  2e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2451  transporter protein  34.48 
 
 
472 aa  197  5e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.507711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.8 
 
 
509 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  34.25 
 
 
471 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  35.41 
 
 
470 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4580  major facilitator superfamily MFS_1  36.72 
 
 
500 aa  193  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1718  major facilitator superfamily MFS_1  38.24 
 
 
500 aa  193  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 
487 aa  192  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2068  major facilitator transporter  36.76 
 
 
496 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal  0.718016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.98 
 
 
496 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2293  major facilitator superfamily MFS_1  34.24 
 
 
513 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  33.93 
 
 
481 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.84 
 
 
553 aa  192  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  35.75 
 
 
454 aa  191  3e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.11 
 
 
499 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.7 
 
 
514 aa  190  6e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  31.59 
 
 
481 aa  189  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3892  major facilitator superfamily MFS_1  39.07 
 
 
511 aa  189  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.741716  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  32.14 
 
 
470 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  7.00007e-06 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
485 aa  187  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4981  major facilitator superfamily MFS_1  35.78 
 
 
518 aa  186  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547375  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  37.45 
 
 
513 aa  186  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.9 
 
 
484 aa  186  1e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.76 
 
 
505 aa  184  2e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0892  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 
508 aa  184  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
506 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  36.38 
 
 
492 aa  183  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.64 
 
 
478 aa  183  8e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.3 
 
 
482 aa  182  8e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  36.95 
 
 
505 aa  181  3e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.91 
 
 
507 aa  181  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.4 
 
 
478 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  36.96 
 
 
501 aa  178  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.03 
 
 
486 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23710  arabinose efflux permease family protein  36.47 
 
 
469 aa  178  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.277036 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.03 
 
 
486 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.03 
 
 
486 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.53 
 
 
502 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.6 
 
 
522 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5374  major facilitator transporter  36.64 
 
 
481 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.558764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.48 
 
 
489 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.03 
 
 
486 aa  177  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.53 
 
 
522 aa  177  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.03 
 
 
486 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.03 
 
 
486 aa  177  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.36 
 
 
479 aa  177  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.57 
 
 
479 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.95 
 
 
469 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.58 
 
 
501 aa  176  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2510  major facilitator superfamily MFS_1  37.81 
 
 
480 aa  176  1e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.8 
 
 
478 aa  175  1e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.99 
 
 
757 aa  175  2e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2211  major facilitator transporter  37.7 
 
 
480 aa  175  2e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214988  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4680  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 
467 aa  174  3e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00880  sugar phosphate permease  33.25 
 
 
458 aa  174  3e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.92 
 
 
500 aa  174  3e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8208  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  35.6 
 
 
463 aa  174  3e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.59 
 
 
482 aa  174  4e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.13 
 
 
479 aa  174  4e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.13 
 
 
479 aa  174  4e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.59 
 
 
482 aa  174  4e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.44 
 
 
469 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 
457 aa  173  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2752  major facilitator transporter  34.81 
 
 
498 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 
480 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.44 
 
 
532 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4243  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.27 
 
 
504 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891003  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1483  drug resistance MFS transporter  36.27 
 
 
480 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.46 
 
 
488 aa  171  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.75 
 
 
478 aa  171  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>