16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7458 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7458  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  768    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0297614  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0051  hypothetical protein  36.67 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4772  hypothetical protein  33.53 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4610  GUN4 domain protein  38.89 
 
 		 684 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  31.13 
 
 		 1150 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5422  hypothetical protein  27.11 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000729862  normal  0.0261161 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6797  hypothetical protein  33.73 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126734  normal  0.776248 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0219  hypothetical protein  33.66 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2006  hypothetical protein  29.13 
 
 		 387 aa  50.1  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  31.54 
 
 		 2216 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0859  hypothetical protein  34.38 
 
 		 593 aa  49.7  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.837601  normal  0.245097 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00325  hypothetical protein  32.26 
 
 		 353 aa  49.3  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.280662  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1812  hypothetical protein  29.79 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881235  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1184  hypothetical protein  29.7 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000411873  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4376  hypothetical protein  28.97 
 
 		 447 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000112995 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0873  hypothetical protein  32.58 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000116337  hitchhiker  0.00593532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>