More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7369 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  100 
 
 
434 aa  896    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  57.38 
 
 
441 aa  514  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  53.97 
 
 
433 aa  464  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  53.52 
 
 
432 aa  462  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  49.41 
 
 
427 aa  431  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  50.69 
 
 
438 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  49.07 
 
 
425 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  47.2 
 
 
437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  47.79 
 
 
437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  45.94 
 
 
438 aa  399  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  47 
 
 
473 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  48.27 
 
 
452 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  46.96 
 
 
435 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  45.97 
 
 
486 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  47 
 
 
447 aa  381  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  43.93 
 
 
437 aa  365  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  44.16 
 
 
439 aa  352  8.999999999999999e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  39.49 
 
 
437 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  39.02 
 
 
437 aa  348  9e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  39.49 
 
 
437 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  39.02 
 
 
437 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  39.02 
 
 
437 aa  342  7e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  39.02 
 
 
437 aa  342  7e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  38.93 
 
 
437 aa  341  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  39.16 
 
 
437 aa  341  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  38.84 
 
 
437 aa  339  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  40.47 
 
 
428 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  42.89 
 
 
475 aa  337  3.9999999999999995e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  38.73 
 
 
434 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  38.23 
 
 
438 aa  335  9e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  41.2 
 
 
445 aa  321  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  39.07 
 
 
470 aa  299  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  38.48 
 
 
436 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  34.98 
 
 
469 aa  256  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  35.83 
 
 
460 aa  253  7e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  35.6 
 
 
440 aa  246  6.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  32.02 
 
 
464 aa  239  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  31.93 
 
 
412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  32.95 
 
 
424 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  33.64 
 
 
442 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.72 
 
 
445 aa  232  8.000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  33.02 
 
 
464 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  32.32 
 
 
429 aa  226  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  32.27 
 
 
478 aa  216  7e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  30.68 
 
 
417 aa  216  8e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  29.44 
 
 
423 aa  215  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  31.03 
 
 
415 aa  209  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.37 
 
 
409 aa  208  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  30.84 
 
 
439 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  30.44 
 
 
411 aa  204  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  29.89 
 
 
415 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  29.74 
 
 
415 aa  203  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  33.49 
 
 
466 aa  193  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.19 
 
 
449 aa  176  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.2 
 
 
417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  34.1 
 
 
423 aa  160  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  30.39 
 
 
421 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.76 
 
 
429 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  27.69 
 
 
574 aa  157  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  30.02 
 
 
418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  28.54 
 
 
437 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  29.89 
 
 
556 aa  144  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  29.35 
 
 
421 aa  143  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  29.17 
 
 
418 aa  141  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.94 
 
 
462 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  28.47 
 
 
427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  29.13 
 
 
430 aa  131  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  25.17 
 
 
448 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  27.06 
 
 
446 aa  119  9e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  27.23 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.87 
 
 
504 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  27.68 
 
 
246 aa  100  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  35.18 
 
 
424 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  28.88 
 
 
572 aa  95.5  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  21.85 
 
 
642 aa  89.7  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  20.79 
 
 
471 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  20.61 
 
 
478 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  21.57 
 
 
468 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  21.23 
 
 
471 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  21.23 
 
 
478 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  22.27 
 
 
478 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  24.22 
 
 
483 aa  82.8  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  22.13 
 
 
478 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  23.13 
 
 
468 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  25.24 
 
 
464 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  21.62 
 
 
478 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  21.23 
 
 
478 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.86 
 
 
463 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.22 
 
 
454 aa  77  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  21.77 
 
 
452 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  27.31 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  25.28 
 
 
481 aa  75.5  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.07 
 
 
472 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.21 
 
 
445 aa  74.7  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.74 
 
 
437 aa  73.6  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  30.72 
 
 
440 aa  73.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  24.11 
 
 
461 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  23.94 
 
 
558 aa  73.2  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  25.13 
 
 
481 aa  72.8  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  23.68 
 
 
457 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>