More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7364 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  100 
 
 
120 aa  231  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  54.24 
 
 
124 aa  114  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3967  CrcB protein  60.58 
 
 
127 aa  114  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0131376  normal  0.336072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  51.67 
 
 
123 aa  111  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  54.17 
 
 
124 aa  111  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  48.74 
 
 
122 aa  104  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  54.17 
 
 
117 aa  100  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4408  camphor resistance protein CrcB  46.23 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 
118 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  40.38 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  42.16 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2660  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28327  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2322  camphor resistance protein CrcB  46.23 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.166352  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  42.86 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  34.51 
 
 
120 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  33.33 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  42.15 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  48.31 
 
 
114 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  33.33 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  42.24 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  40.17 
 
 
132 aa  76.6  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 
118 aa  77  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  40.35 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13087  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3757  normal  0.719495 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  43.56 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  44.35 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  39.8 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2698  CrcB protein  52.27 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154728  hitchhiker  0.000362738 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1726  camphor resistance protein CrcB  46.88 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390314  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1773  camphor resistance protein CrcB  46.88 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284335  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1705  camphor resistance protein CrcB  46.88 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.439733  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  44.55 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0455  Camphor resistance CrcB protein  37.74 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.592746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  41.38 
 
 
119 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  49.54 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  41.57 
 
 
118 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3962  CrcB protein  36.04 
 
 
118 aa  72  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  39.05 
 
 
124 aa  72  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  39.81 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  42.05 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2949  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478651  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  40 
 
 
123 aa  72  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 
123 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  38 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  41.57 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  39.18 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  36.67 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4411  camphor resistance protein CrcB  44.55 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  37.93 
 
 
124 aa  70.1  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  37.5 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3029  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  43.75 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  43.86 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  35.9 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0192  Camphor resistance CrcB protein  42.72 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0113998  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  41.38 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  43.86 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  40.57 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  36.21 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  36.52 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  39.67 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  42.42 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  35.25 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  36.52 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  35.25 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  35.29 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>