More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7285 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
349 aa  686  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  74.05 
 
 
343 aa  525  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  73.47 
 
 
343 aa  521  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  75.68 
 
 
368 aa  514  1e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  74.26 
 
 
344 aa  512  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  73 
 
 
343 aa  512  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  71.97 
 
 
344 aa  499  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  70.21 
 
 
342 aa  496  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  69.73 
 
 
343 aa  495  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  70.41 
 
 
350 aa  481  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  69.82 
 
 
344 aa  476  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  66.57 
 
 
346 aa  457  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.02365e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  68.34 
 
 
342 aa  455  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  65 
 
 
340 aa  454  1e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  64.78 
 
 
340 aa  448  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  65.37 
 
 
343 aa  451  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1529  rod shape-determining protein MreB  66.27 
 
 
342 aa  443  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0844761  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  64.44 
 
 
343 aa  438  1e-122  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  4.55643e-09 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  63.39 
 
 
343 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  65.43 
 
 
344 aa  433  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  62.39 
 
 
342 aa  434  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  62.87 
 
 
343 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  63.77 
 
 
347 aa  433  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  62.39 
 
 
342 aa  434  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  63.55 
 
 
347 aa  430  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.83454e-11  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  61.38 
 
 
343 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  6.77131e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  65.15 
 
 
344 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  62.95 
 
 
347 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  7.07423e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  62.95 
 
 
347 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  63.95 
 
 
344 aa  425  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  63.25 
 
 
347 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.81914e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  63.03 
 
 
339 aa  425  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  7.59245e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  62.28 
 
 
347 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.97933e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  62.46 
 
 
344 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  62.73 
 
 
343 aa  419  1e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  61.86 
 
 
344 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  61.56 
 
 
344 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  61.56 
 
 
344 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  61.56 
 
 
344 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  61.26 
 
 
344 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  61.56 
 
 
344 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  62.16 
 
 
343 aa  417  1e-115  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  61.75 
 
 
346 aa  416  1e-115  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  62.02 
 
 
347 aa  414  1e-115  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.22229e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  62.28 
 
 
340 aa  414  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  1.87033e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  61.13 
 
 
347 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  6.6828e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  60.3 
 
 
346 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  60.3 
 
 
346 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  58.61 
 
 
354 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  60.9 
 
 
346 aa  411  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  59.94 
 
 
348 aa  406  1e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  2.8278e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  59.82 
 
 
346 aa  407  1e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  60.54 
 
 
338 aa  404  1e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  61.38 
 
 
358 aa  407  1e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  59.94 
 
 
339 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  59.94 
 
 
339 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  61.23 
 
 
339 aa  401  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  61.08 
 
 
358 aa  402  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  59.94 
 
 
339 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  59.94 
 
 
338 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  62.58 
 
 
340 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  59.94 
 
 
339 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  59.94 
 
 
339 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  59.94 
 
 
339 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  58.9 
 
 
345 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  59.94 
 
 
339 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  60.12 
 
 
359 aa  398  1e-110  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  2.40311e-05  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  60 
 
 
346 aa  399  1e-110  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1150  rod shape-determining protein MreB  59.45 
 
 
345 aa  400  1e-110  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1388  rod shape-determining protein MreB  58.11 
 
 
343 aa  399  1e-110  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  59.65 
 
 
348 aa  400  1e-110  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  5.73376e-09 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  59.94 
 
 
339 aa  400  1e-110  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  59.94 
 
 
339 aa  401  1e-110  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  60.06 
 
 
342 aa  398  1e-110  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1734  rod shape-determining protein MreB  59.35 
 
 
344 aa  399  1e-110  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  5.50029e-06  normal  0.180064 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  59.94 
 
 
339 aa  401  1e-110  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  61.83 
 
 
346 aa  399  1e-110  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  60.36 
 
 
336 aa  395  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0670  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  61.49 
 
 
347 aa  395  1e-109  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2749  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  57.85 
 
 
339 aa  395  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0300  rod shape-determining protein MreB  60.48 
 
 
345 aa  393  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3282  rod shape-determining protein Mbl  56.31 
 
 
333 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.25947e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  58.82 
 
 
346 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0866  MreB/Mrl family cell shape determining protein  59.15 
 
 
335 aa  394  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2133  rod shape-determining protein Mbl  56.79 
 
 
343 aa  389  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1461  rod shape-determining protein MreB  58.97 
 
 
347 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  3.97491e-10  unclonable  2.42005e-07 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  53.53 
 
 
342 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  54.98 
 
 
344 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4777  rod shape-determining protein MreB  58.94 
 
 
353 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529713  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1412  rod shape-determining protein MreB  60.12 
 
 
344 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  4.97097e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0109  rod shape-determining protein Mbl  55.02 
 
 
343 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  58.9 
 
 
344 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3394  rod shape-determining protein Mbl  55.08 
 
 
333 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2374  rod shape-determining protein Mbl  56.12 
 
 
342 aa  385  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0449993  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  59.02 
 
 
348 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3144  rod shape-determining protein Mbl  58.18 
 
 
344 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  59.02 
 
 
347 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  1.88341e-06 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  55.56 
 
 
345 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  56.12 
 
 
348 aa  378  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  1.35004e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3391  rod shape-determining protein MreB  59.04 
 
 
352 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.112256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>