More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7281 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7281  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 407 aa  798    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  49.63 
 
 		 413 aa  345  6e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  49.09 
 
 		 387 aa  333  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  53.25 
 
 		 401 aa  331  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  48.04 
 
 		 386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1215  cell cycle protein  49.37 
 
 		 411 aa  317  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323316  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5265  cell cycle protein  47.89 
 
 		 411 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  41.05 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  43.47 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2186  Sfr protein  46.62 
 
 		 407 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117598  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  40.11 
 
 		 365 aa  266  7e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0752  cell cycle protein  46.56 
 
 		 401 aa  262  8.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1684  rod shape-determining protein RodA  45.71 
 
 		 381 aa  259  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.199967 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  38.87 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11520  rod shape-determining protein RodA  41.9 
 
 		 423 aa  244  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0049464  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  40.56 
 
 		 377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  34.79 
 
 		 376 aa  233  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  37.73 
 
 		 380 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  39.9 
 
 		 388 aa  229  7e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  34.54 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  34.12 
 
 		 419 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  39.35 
 
 		 366 aa  222  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  38.18 
 
 		 378 aa  222  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1261  cell cycle protein  38.68 
 
 		 397 aa  216  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0112895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  34.29 
 
 		 369 aa  216  8e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  37.8 
 
 		 366 aa  215  9e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  35.25 
 
 		 398 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  36.58 
 
 		 372 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  36.53 
 
 		 373 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2650  cell cycle protein  35.47 
 
 		 391 aa  210  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.115542  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  31.33 
 
 		 417 aa  210  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  33.01 
 
 		 412 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  34.41 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0674  cell cycle protein  34.73 
 
 		 408 aa  206  4e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.935594  normal  0.572504 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  35.87 
 
 		 407 aa  207  4e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  35.82 
 
 		 426 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  33.85 
 
 		 388 aa  206  7e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  36.76 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  32.91 
 
 		 378 aa  204  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  34.76 
 
 		 371 aa  203  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  35.01 
 
 		 367 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  35.95 
 
 		 369 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  36.25 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  32.72 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  37.47 
 
 		 405 aa  199  7e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  35.48 
 
 		 366 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  35.19 
 
 		 363 aa  199  9e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  33.1 
 
 		 417 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  33.1 
 
 		 417 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  35.17 
 
 		 367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  35.75 
 
 		 366 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  33.94 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  33.94 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  36.77 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  34.81 
 
 		 387 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  37.2 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  38.64 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  32.21 
 
 		 421 aa  193  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  35.44 
 
 		 404 aa  193  4e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0567  rod shape-determining protein roda  34.67 
 
 		 360 aa  193  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.398514  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  35.48 
 
 		 366 aa  192  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  31.13 
 
 		 366 aa  192  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  33.95 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  35.12 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  34.29 
 
 		 385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2103  cell cycle protein FtsW  33.59 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000319192  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  36.36 
 
 		 371 aa  190  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2391  cell cycle protein FtsW  33.85 
 
 		 374 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00202721  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  29.5 
 
 		 438 aa  189  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  35.06 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  30.7 
 
 		 423 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  39.58 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  32.24 
 
 		 408 aa  186  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0779  cell cycle protein  33.25 
 
 		 390 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  34.96 
 
 		 365 aa  186  8e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  32.89 
 
 		 368 aa  186  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  31.95 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  29.26 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  32.89 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  32.35 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  34.46 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  33.16 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2013  rod shape-determining protein RodA  34.02 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0547466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  34.77 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  35.21 
 
 		 408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  35.78 
 
 		 403 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  35.11 
 
 		 371 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  33.51 
 
 		 374 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  34.28 
 
 		 384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  35.78 
 
 		 364 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  32.56 
 
 		 368 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  36.39 
 
 		 371 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1554  rod shape-determining protein RodA  37.53 
 
 		 357 aa  182  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  32.63 
 
 		 368 aa  182  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  32.38 
 
 		 372 aa  182  8.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1325  cell cycle protein FtsW  35.91 
 
 		 386 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  32.82 
 
 		 376 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4083  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  35.01 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  35.05 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  35.36 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>